More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0122 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  72.14 
 
 		 146 aa  207  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  61.7 
 
 		 151 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  60.87 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  57.45 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  52.55 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  49.62 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  49.24 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  43.24 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  40.28 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.29 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.83 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.97 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  38.69 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  40.74 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  41.82 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  39.58 
 
 		 161 aa  97.1  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  40.29 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.14 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  38.06 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  37.41 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  38.97 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  37.96 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  36.76 
 
 		 149 aa  94.7  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  37.88 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  34.09 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  39.29 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  36.57 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  35.29 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  34.06 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  38.85 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  38.13 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  34.33 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.69 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  34.33 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.41 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  43.65 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.24 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  39.66 
 
 		 188 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  37.78 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  34.06 
 
 		 163 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  37.41 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  38.13 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  40.83 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  31.16 
 
 		 173 aa  87.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.97 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  38.79 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  35.43 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  38.79 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  31.91 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  41.9 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0893  protein of unknown function UPF0079  39.39 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  34.29 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  36.96 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  33.58 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  30.22 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  34.04 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2605  hypothetical protein  36.92 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  38.1 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  35.97 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  36.23 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  32.65 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  40.17 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  33.57 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3209  hypothetical protein  35.07 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000564317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  34.65 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  36.23 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0082  hypothetical protein  41.28 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.659659 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  33.82 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2676  hypothetical protein  40.16 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  41.84 
 
 		 505 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29240  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  32.09 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0703  putative ATPase  33.9 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000204367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  36.57 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1380  hypothetical protein  36.61 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3657  putative ATPase  33.9 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3803  putative ATPase  33.9 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000296648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  30.34 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  37.39 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  33.08 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2754  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2627  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  39.32 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.523389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>