More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0112 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 258 aa  536  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  37.02 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.66 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.62 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.22 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  37.02 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  40.12 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  35.52 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.17 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.77 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  36.92 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  28.29 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  31.92 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.84 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.57 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  32.61 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  32.22 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.27 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.42 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  39.52 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.72 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.72 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.72 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  26.72 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.38 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.34 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.06 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.42 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.98 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.38 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  26.74 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.95 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.58 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.83 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.92 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.84 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  29.86 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.52 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.86 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.03 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  29.86 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  29.86 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  29.86 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  29.86 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  29.86 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.29 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.61 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.87 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.02 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.44 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.16 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.71 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.44 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.96 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  31.06 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.75 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.61 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.57 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.39 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.61 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.57 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  25 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.67 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  33.05 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  29.05 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  29.05 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  27.27 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.52 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.04 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.48 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.15 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  28.47 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.9 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.01 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.45 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>