More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0110 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0131  TPR repeat-containing protein  57.96 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0092  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0096  TPR repeat-containing protein  39.05 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00110052  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  38.69 
 
 		 248 aa  137  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.78 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  87.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  37.9 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  34.59 
 
 		 581 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  35.34 
 
 		 582 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.81 
 
 		 706 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.57 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40.38 
 
 		 706 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.03 
 
 		 738 aa  78.2  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 361 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.46 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.07 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 404 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.06 
 
 		 462 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  35.43 
 
 		 750 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.58 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.58 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  31.91 
 
 		 539 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  38.24 
 
 		 635 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.65 
 
 		 1022 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 		 308 aa  71.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.06 
 
 		 442 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  30.82 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 649 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 617 aa  68.2  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.94 
 
 		 988 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.51 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 280 aa  67.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00551  hypothetical protein  29.37 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  36.84 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1770  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.18 
 
 		 818 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.96 
 
 		 471 aa  64.7  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  28.91 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 		 261 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 4489 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.72 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.09 
 
 		 1056 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 556 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3560 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  38.27 
 
 		 338 aa  62  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.24 
 
 		 1240 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1056 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 750 aa  61.2  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.27 
 
 		 784 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 376 aa  60.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.94 
 
 		 746 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.17 
 
 		 820 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 425 aa  58.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1276 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 804 aa  58.2  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 318 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1168  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.703043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 373 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>