87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0094 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0094  Ion transport 2 domain protein  100 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  77.59 
 
 		 345 aa  94  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  44.44 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  47.62 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  51.79 
 
 		 350 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  45.16 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  51.72 
 
 		 350 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  48.39 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  41.94 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  49.06 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  42.62 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  42.62 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  42.62 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  44.44 
 
 		 337 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  49.06 
 
 		 350 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  41.94 
 
 		 350 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  64.1 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  43.55 
 
 		 352 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  41.94 
 
 		 347 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  40.98 
 
 		 359 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  47.37 
 
 		 346 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 273 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  44.64 
 
 		 346 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  45.28 
 
 		 333 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  48.94 
 
 		 354 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  42.37 
 
 		 341 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  54.55 
 
 		 396 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  48.21 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  48.21 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  42.62 
 
 		 346 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  44.07 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  48.94 
 
 		 355 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  39.68 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  43.86 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  42 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  36.36 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  38.18 
 
 		 376 aa  45.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0700  Ion transport 2 domain protein  37.74 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00257952  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  33.85 
 
 		 408 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  33.85 
 
 		 438 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  32.73 
 
 		 397 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  48.72 
 
 		 352 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  38.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  35.71 
 
 		 335 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  38.6 
 
 		 332 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  52.63 
 
 		 351 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4630  hypothetical protein  41.18 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696227  hitchhiker  0.00000000000143872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  44.68 
 
 		 356 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  44.68 
 
 		 356 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  34.43 
 
 		 324 aa  43.5  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  42.31 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6042  Ion transport 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4579  Ion transport 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5039  Ion transport 2 domain protein  40.91 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.103655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  36.73 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0706  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  32.26 
 
 		 330 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0642  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0586  potassium channel protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000724625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0743  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0731  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0746600000000001e-44 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 376 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0676  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000494149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0590  Ion transport 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 114 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0803  hypothetical protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0585  potassium channel protein  39.22 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 330 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0771  hypothetical protein  36.21 
 
 		 376 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.94547  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  30.65 
 
 		 335 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1814  Ion transport 2 domain-containing protein  43.64 
 
 		 266 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  43.14 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4869  Ion transport 2 domain-containing protein  43.9 
 
 		 271 aa  40.8  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  41.18 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  37.74 
 
 		 332 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  43.48 
 
 		 416 aa  40.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 		 420 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  30.65 
 
 		 337 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  31.75 
 
 		 420 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  30.65 
 
 		 330 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>