More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0090 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 190 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  64.09 
 
 		 506 aa  251  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  65.54 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  65.14 
 
 		 177 aa  235  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  72.6 
 
 		 150 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  53.76 
 
 		 171 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  52.2 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  54.97 
 
 		 171 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  62.41 
 
 		 154 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  55.24 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  52.8 
 
 		 147 aa  147  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  51.64 
 
 		 132 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  53.49 
 
 		 132 aa  144  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 		 163 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  55.74 
 
 		 137 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 140 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  50.79 
 
 		 138 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 		 139 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  49.24 
 
 		 140 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 		 134 aa  141  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 		 159 aa  141  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 		 136 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  49.6 
 
 		 133 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  50.75 
 
 		 136 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  51.59 
 
 		 135 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 		 137 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 137 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.26 
 
 		 133 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  50.41 
 
 		 136 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  51.67 
 
 		 148 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  54.1 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 		 135 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 		 131 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 		 142 aa  138  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  49.61 
 
 		 144 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 128 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  52.89 
 
 		 131 aa  137  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 		 137 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 		 138 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  48.06 
 
 		 133 aa  137  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  51.26 
 
 		 131 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  51.26 
 
 		 131 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  50.42 
 
 		 131 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  50.41 
 
 		 135 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  49.63 
 
 		 137 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  48 
 
 		 133 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.42 
 
 		 134 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 128 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 		 128 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  54.7 
 
 		 180 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 		 155 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  49.57 
 
 		 130 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  50.41 
 
 		 133 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  46.85 
 
 		 147 aa  134  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  51.56 
 
 		 150 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.18 
 
 		 139 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 		 131 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  50.85 
 
 		 135 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1925  methionine sulfoxide reductase B  50.85 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0476823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  51.22 
 
 		 154 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 		 164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  50.82 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  47.58 
 
 		 127 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 141 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2001  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0768208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  49.58 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 141 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 134 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  48.76 
 
 		 136 aa  131  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  51.64 
 
 		 133 aa  131  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  47.93 
 
 		 135 aa  131  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  49.58 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  49.18 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  48.76 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  49.17 
 
 		 136 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 136 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2964  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  50.43 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  49.15 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  44.36 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2552  methionine-R-sulfoxide reductase  45.52 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  48.06 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  43.45 
 
 		 137 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  46.03 
 
 		 136 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 		 132 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  48.76 
 
 		 141 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>