40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0070 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0070  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  266  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0082  hypothetical protein  78.1 
 
 
209 aa  194  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2386  hypothetical protein  72.06 
 
 
173 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1853  hypothetical protein  66.17 
 
 
169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4189  hypothetical protein  65 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18200  hypothetical protein  77.38 
 
 
85 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4776  hypothetical protein  44.38 
 
 
218 aa  114  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3651  hypothetical protein  46.72 
 
 
135 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.559978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6022  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0878521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2725  hypothetical protein  47.76 
 
 
127 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10817  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4845  hypothetical protein  51.28 
 
 
142 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0933  hypothetical protein  47.83 
 
 
137 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823295  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4369  hypothetical protein  50.43 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5538  hypothetical protein  67.47 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0167677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4267  hypothetical protein  44.52 
 
 
145 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831711  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1558  hypothetical protein  55.88 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908267  normal  0.651705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3165  hypothetical protein  48.51 
 
 
130 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.838623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1755  hypothetical protein  55.21 
 
 
149 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7475  hypothetical protein  54.21 
 
 
157 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.579017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2129  hypothetical protein  46.05 
 
 
148 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.388203  normal  0.874817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0055  hypothetical protein  92.59 
 
 
78 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2769  hypothetical protein  46.97 
 
 
127 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5801  hypothetical protein  47.14 
 
 
138 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1762  hypothetical protein  45.11 
 
 
124 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0701529  normal  0.0375029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1806  hypothetical protein  43.94 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2770  hypothetical protein  55.68 
 
 
127 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1950  hypothetical protein  45.3 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4170  hypothetical protein  61.04 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0299  hypothetical protein  47.37 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000865881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1843  hypothetical protein  43.24 
 
 
147 aa  94  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0325  hypothetical protein  46.62 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0691109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2463  hypothetical protein  45.86 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0823141  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1779  hypothetical protein  44.36 
 
 
133 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0430501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0169  hypothetical protein  41.29 
 
 
198 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4393  hypothetical protein  64.71 
 
 
135 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0455324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5074  hypothetical protein  61.76 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2129  hypothetical protein  48.48 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1883  hypothetical protein  58.93 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5347  hypothetical protein  54.65 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.975966 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08115  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 
419 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0160028  normal  0.190332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>