41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0069 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0069  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 108 aa  216  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0292  DNA polymerase beta subunit  76.42 
 
 		 108 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0233  DNA polymerase beta domain protein region  75.47 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1207  DNA polymerase beta subunit  61.39 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0095  DNA polymerase beta subunit  61.39 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.365343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  59.8 
 
 		 123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5240  DNA polymerase beta domain protein region  52.43 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1475  DNA polymerase beta domain protein region  54.46 
 
 		 100 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  52.53 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0897  HsdR-like, putative type I restriction deoxyribonuclease  45.36 
 
 		 1294 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02490  nucleotidyltransferase  46.94 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456196  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0491  hypothetical protein  39.42 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.484621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2655  DNA polymerase beta subunit  37.11 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.748854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0594  hypothetical protein  38 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1466  hypothetical protein  65.62 
 
 		 64 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  42.27 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1656  DNA polymerase beta domain protein region  50.5 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1691  DNA polymerase beta domain protein region  36.96 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0339005 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0763  DNA polymerase beta domain protein region  27.36 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0769  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0754  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.923157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0284  DNA polymerase beta domain protein region  29.13 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0806  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  31.82 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1349  DNA polymerase beta domain protein region  32.58 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2573  DNA polymerase beta domain protein region  27.27 
 
 		 97 aa  50.8  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0668582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0295  DNA polymerase beta domain protein region  28 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  27 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1772  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0051  DNA polymerase beta subunit  38.16 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0498801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1560  DNA polymerase beta domain protein region  29.29 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0347  DNA polymerase beta domain protein region  32.32 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  38.24 
 
 		 273 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0270  nucleotidyltransferase domain-containing protein  29.7 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1381  DNA polymerase beta domain protein region  28.28 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4507  DNA polymerase beta subunit  28 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0041  DNA polymerase beta domain protein region  34.41 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  24.39 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  32.56 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3011  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  31.58 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1064  hypothetical protein  62.96 
 
 		 53 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.162255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>