157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0064 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  100 
 
 
391 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  58.12 
 
 
385 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  53.63 
 
 
388 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  50.79 
 
 
386 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  49.05 
 
 
392 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  50.92 
 
 
386 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  48.44 
 
 
392 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  48.84 
 
 
389 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  49.6 
 
 
394 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  48.28 
 
 
402 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  47.49 
 
 
380 aa  350  2e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  43.72 
 
 
385 aa  349  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  47.29 
 
 
339 aa  334  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  40.57 
 
 
418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  42.06 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  41.83 
 
 
474 aa  269  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  41.69 
 
 
421 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  37.63 
 
 
408 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  40.11 
 
 
409 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  36.29 
 
 
409 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  46.29 
 
 
259 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  32.82 
 
 
415 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  34.13 
 
 
418 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  34.58 
 
 
412 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  35.86 
 
 
388 aa  202  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  30.63 
 
 
412 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  33.68 
 
 
415 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  33.61 
 
 
407 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1454  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  70.4 
 
 
135 aa  195  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0125598  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  32.96 
 
 
406 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  32.87 
 
 
411 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  35.44 
 
 
416 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  32.05 
 
 
408 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  33.43 
 
 
406 aa  189  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  35.07 
 
 
417 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  33.43 
 
 
406 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  32.64 
 
 
426 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  32.55 
 
 
383 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  33.33 
 
 
412 aa  179  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  33.15 
 
 
416 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  32.17 
 
 
412 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  32.14 
 
 
392 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  32.65 
 
 
388 aa  170  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  31.56 
 
 
383 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  47.98 
 
 
229 aa  168  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  34.17 
 
 
413 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  33.03 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  34.28 
 
 
380 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  30.52 
 
 
454 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  33.23 
 
 
390 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  33.75 
 
 
441 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  30.52 
 
 
426 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  33.23 
 
 
402 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  29.65 
 
 
425 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  31.87 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  29.74 
 
 
394 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  30.21 
 
 
388 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  32.65 
 
 
394 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  28.94 
 
 
436 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  32.37 
 
 
391 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  31.86 
 
 
392 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  31.68 
 
 
389 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  28.9 
 
 
390 aa  144  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  31.72 
 
 
387 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  29.55 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  31.94 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  27.51 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  26.84 
 
 
390 aa  129  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  28.41 
 
 
350 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  27.98 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  26.69 
 
 
382 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  27.45 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  27.17 
 
 
386 aa  112  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  26.61 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  29.7 
 
 
378 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  29.31 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  25.83 
 
 
419 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.83 
 
 
398 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  27.36 
 
 
427 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  27.36 
 
 
427 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.93 
 
 
382 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  25.77 
 
 
407 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  26.21 
 
 
402 aa  97.4  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  24.6 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.56 
 
 
393 aa  96.3  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  29.95 
 
 
269 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.44 
 
 
377 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  27.16 
 
 
379 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3441  AAA family ATPase  56.34 
 
 
81 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  25.66 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  26.36 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  24.88 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  27.32 
 
 
417 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  23.91 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  23.84 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  25.06 
 
 
408 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  25.39 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  25.07 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  24.09 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1016  AAA family ATPase  23.82 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0133655 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>