16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0056 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0056  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1709  hypothetical protein  64.91 
 
 
114 aa  157  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2196  hypothetical protein  61.61 
 
 
114 aa  156  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2877  hypothetical protein  45.95 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00521962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3039  hypothetical protein  48.18 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54673  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1985  hypothetical protein  42.86 
 
 
111 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1889  hypothetical protein  31.63 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2091  hypothetical protein  30.48 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1914  hypothetical protein  30.61 
 
 
110 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0652972  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1800  hypothetical protein  27.78 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4190  hypothetical protein  25.96 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.215857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4512  hypothetical protein  31.03 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.90814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0600  hypothetical protein  25 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476447  normal  0.181324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0499  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0081  hypothetical protein  25.81 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4962  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>