More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0027 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0027  aminotransferase class V  100 
 
 		 455 aa  936    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  36 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1124  aminotransferase, class V  32.53 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.994048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5319  aminotransferase class V  31.62 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3648  aminotransferase class V  32.48 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  30.61 
 
 		 476 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4279  aminotransferase class V  29.51 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  29.47 
 
 		 469 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  28.14 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3047  aminotransferase class V  25.84 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.500863  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6132  aminotransferase class V  31.53 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  26.64 
 
 		 415 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  32.69 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1756  aminotransferase class V  31.82 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60376  normal  0.594036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25.68 
 
 		 395 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  25 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.61 
 
 		 406 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  28.01 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  28.01 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  28.01 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.41 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  29.61 
 
 		 401 aa  93.6  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.61 
 
 		 408 aa  93.2  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  27.41 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  29.51 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  27.41 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  30.84 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  26.7 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  27.41 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  27.41 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  27.41 
 
 		 406 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  27.71 
 
 		 406 aa  90.5  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  27.78 
 
 		 394 aa  89.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  25.1 
 
 		 437 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4973  putative aminotransferase  25.6 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  28.57 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3800  aminotransferase class V  25.8 
 
 		 433 aa  86.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2865  aminotransferase  26.86 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33720  PvdN  26.86 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000909297  hitchhiker  0.00809469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2941  aminotransferase class V  27.05 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3921  aminotransferase class V  24.65 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  30.56 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2309  aminotransferase, class V  34.59 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.422271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  28.16 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.38 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.03 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.09 
 
 		 880 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  24.08 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.35 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.77 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  27.5 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.45 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.15 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.77 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  27.43 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  25.17 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.6 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2155  aminotransferase, class V  25.41 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2195  aminotransferase class V  25.49 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  23.97 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  26 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.5 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  26.16 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.61 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.48 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1478  twin-arginine translocation pathway signal  23.83 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  23.19 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2318  aminotransferase, class V  23.93 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1687  twin-arginine translocation pathway signal  23.78 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.18 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  26.61 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.72 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3297  aminotransferase, class V  24.01 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  24.18 
 
 		 879 aa  76.6  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  22.36 
 
 		 878 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04341  putative L-cysteine/cystine lyase  24.75 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.12464  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  25.08 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64026  cysteine desulfurase Selenocysteine lyase  24.39 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.867854  normal  0.0377472 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5541  aminotransferase, class V  25.68 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  26.34 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.33 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1965  twin-arginine translocation pathway signal  23.85 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412227  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  24.68 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.59 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  24.71 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  27.71 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  26.88 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.88 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  22.68 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  23.75 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.14 
 
 		 885 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.76 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.51 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04761  putative L-cysteine/cystine lyase  22.92 
 
 		 391 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  25 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.39 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.12 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.66 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  23.88 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>