23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0022 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0022  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0154807  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0022  hypothetical protein  72.73 
 
 
224 aa  345  3e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00321696  hitchhiker  0.00325564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0021  hypothetical protein  63.93 
 
 
237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0043  hypothetical protein  63.47 
 
 
239 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0028  hypothetical protein  58.74 
 
 
228 aa  276  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0015  hypothetical protein  59.36 
 
 
231 aa  272  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0034  hypothetical protein  57.64 
 
 
230 aa  272  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4477  hypothetical protein  34.41 
 
 
93 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1757  hypothetical protein  31.96 
 
 
106 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2745  hypothetical protein  28.87 
 
 
96 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3373  hypothetical protein  29.17 
 
 
96 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2746  hypothetical protein  26 
 
 
111 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0790  hypothetical protein  26.53 
 
 
101 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4012  hypothetical protein  30.3 
 
 
99 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10662  predicted protein  34.94 
 
 
86 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.959438  normal  0.0262424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4050  hypothetical protein  30.3 
 
 
99 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3374  hypothetical protein  26.32 
 
 
102 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730978  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1528  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462653  hitchhiker  0.00252515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0791  hypothetical protein  30.93 
 
 
98 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09861  hypothetical protein  30.77 
 
 
100 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1427  hypothetical protein  34.15 
 
 
95 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0577144 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_8301  predicted protein  32.89 
 
 
80 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0921  hypothetical protein  30.99 
 
 
100 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>