More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0012 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 308 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000296376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  73.94 
 
 		 309 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  65.8 
 
 		 311 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  64.5 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  64.5 
 
 		 310 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  67.53 
 
 		 311 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000001158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  65.26 
 
 		 311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  46.44 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  43.14 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  38.36 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  41.98 
 
 		 286 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  39.2 
 
 		 1001 aa  216  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0562  protein-export membrane protein SecF  39.03 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  41.04 
 
 		 337 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  41.04 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.93 
 
 		 996 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  43.48 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  41.37 
 
 		 1029 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.47 
 
 		 991 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  42.52 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  41.16 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  38.87 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  42.81 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  39.8 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  37.21 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  37.21 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  36.93 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 323 aa  201  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  36.88 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.77 
 
 		 995 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  37.17 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  43.24 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  41.23 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.16 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  38.06 
 
 		 323 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  38.33 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  34.82 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  40.91 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  39.73 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.95 
 
 		 1055 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1085  preprotein translocase subunit SecF  37.82 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.161965 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  39.38 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  37.85 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.52 
 
 		 856 aa  192  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  36.07 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  36.21 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  41.46 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  36.89 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  37.05 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  36.27 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  38.78 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  37.54 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.6 
 
 		 990 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0540  preprotein translocase subunit SecF  33.9 
 
 		 361 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0258314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0682  protein-export membrane protein SecF  36.87 
 
 		 357 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  39.09 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  39.45 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  38.94 
 
 		 759 aa  188  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  39.19 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  37.58 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  35.01 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  38.14 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  38.14 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  38.14 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40450  preprotein translocase subunit SecF  39.53 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.193489  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.97 
 
 		 762 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  37.5 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0123  protein-export membrane protein SecF  36.24 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  37.15 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.59 
 
 		 995 aa  186  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2185  protein-export membrane protein SecF  35.2 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.76 
 
 		 735 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14650  preprotein translocase subunit SecF  38.19 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  35.99 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  36.36 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>