79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0028 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0032  tRNA-Pro  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0034  tRNA-Pro  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129809  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0035  tRNA-Pro  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000987265  normal  0.0118441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0057  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0011  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0269347  normal  0.199214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0066  tRNA-Pro  95.74 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.89097e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13260  tRNA-Pro  94 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0382436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0029  tRNA-Pro  95 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.264372  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0049  tRNA-Pro  93.62 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.098355  normal  0.904271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna13  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0109171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0083  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000012865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0031  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19520  tRNA-Pro  95.12 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00000755205  hitchhiker  0.000000818157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0063  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0018  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 78 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0029  tRNA-Ala  86.44 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.978783  normal  0.786802 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0047  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0047  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0062  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000001951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0010  tRNA-Pro  90.7 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0048  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.917101  hitchhiker  0.00792166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0056  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0018  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0768542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0007  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0022  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0066  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.880566  normal  0.0590794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0032  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0015  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0018  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.662018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0066  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0002  tRNA-Pro  87.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00636416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  84.48 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0026  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0064  tRNA-Pro  86.96 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0282  tRNA-Pro  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000340373  hitchhiker  0.0000247007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.200882  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0008  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.802652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA48  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.719736  normal  0.23848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0048271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0001  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  84.48 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>