46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_R0022 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_R0012  tRNA-Glu  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013239  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0022  tRNA-Glu  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000000692994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0044  tRNA-Glu  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000772538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0010  tRNA-Glu  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0004  tRNA-Glu  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0043  tRNA-Glu  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000374465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t37  tRNA-Glu  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0040  tRNA-Glu  91.67 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0111833  normal  0.897569 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0011  tRNA-Glu  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0060  tRNA-Glu  91.18 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0003  tRNA-Glu  94 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0062  tRNA-Glu  90.77 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.427189  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0041  tRNA-Glu  89.39 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0061  tRNA-Glu  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  88.24 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0014  tRNA-Glu  95 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178243  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  88.24 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0083  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0030  tRNA-Glu  92.86 
 
 
76 bp  60  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000392756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0039  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  85.07 
 
 
75 bp  54  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01850  tRNA-Glu  88 
 
 
73 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0002  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240355  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0054  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0043  tRNA-Glu  85.29 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000194529  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  90 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0061  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0048  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.849322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0043  tRNA-Glu  84.29 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0981603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25080  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  100 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>