64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2705 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.28169e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  48.61 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  55 
 
 
61 aa  73.9  6e-13  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  71.2  4e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  43.21 
 
 
83 aa  69.7  1e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  68.9  2e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  43.75 
 
 
76 aa  67  8e-11  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.31337e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  49.25 
 
 
67 aa  65.1  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  61.6  4e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  61.6  4e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  50.85 
 
 
64 aa  60.8  6e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2478  hypothetical protein  51.67 
 
 
61 aa  60.8  6e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  39.66 
 
 
62 aa  60.1  1e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  47.46 
 
 
66 aa  57.8  4e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  40.35 
 
 
83 aa  57  9e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  49.12 
 
 
65 aa  56.6  1e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  42.62 
 
 
65 aa  55.8  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  55.5  2e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  55.1  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  55.5  3e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  55.5  3e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  44.07 
 
 
67 aa  55.5  3e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  37.5 
 
 
66 aa  54.3  6e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  43.1 
 
 
63 aa  53.1  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  44.26 
 
 
62 aa  52.4  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  39.34 
 
 
63 aa  51.6  3e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0785  hypothetical protein  37.04 
 
 
66 aa  51.6  4e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  40.58 
 
 
91 aa  51.2  4e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  37.7 
 
 
68 aa  50.8  7e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  3.44489e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  38.98 
 
 
62 aa  50.1  9e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  40.68 
 
 
64 aa  49.7  1e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  38.98 
 
 
64 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  50.1  1e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  34.67 
 
 
82 aa  49.7  2e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  40.68 
 
 
63 aa  48.5  3e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  48.5  3e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  37.93 
 
 
61 aa  48.1  4e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  37.93 
 
 
63 aa  47.8  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  36.62 
 
 
72 aa  47.8  5e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  37.93 
 
 
62 aa  47.8  5e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  41.43 
 
 
69 aa  47.4  6e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  35.48 
 
 
64 aa  47.4  7e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  47  8e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  38.98 
 
 
63 aa  47  8e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  37.93 
 
 
62 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  38.1 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  38.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  32.39 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  40.35 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  40.68 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  34.85 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1300  hypothetical protein  45.9 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.428744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  37.5 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  34.48 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  36.51 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  35.53 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  39.06 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  47.46 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  34.78 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  31.94 
 
 
78 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  31.75 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  32.39 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>