184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2626 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  80.43 
 
 
205 aa  322  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  72.83 
 
 
187 aa  293  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  72.83 
 
 
207 aa  291  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0073  transposase  73.22 
 
 
186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  62.84 
 
 
220 aa  260  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  62.84 
 
 
220 aa  260  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  62.84 
 
 
220 aa  260  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  62.84 
 
 
220 aa  260  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  62.84 
 
 
220 aa  258  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  54.59 
 
 
390 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  53.51 
 
 
206 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  48.35 
 
 
205 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  48.91 
 
 
207 aa  186  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  49.18 
 
 
375 aa  184  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  44.02 
 
 
223 aa  158  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  43.78 
 
 
215 aa  157  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  79.55 
 
 
90 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  64.08 
 
 
105 aa  148  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  44.44 
 
 
146 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  73.24 
 
 
105 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  68.66 
 
 
67 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  41.84 
 
 
172 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  46.81 
 
 
171 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  30.6 
 
 
377 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  30.6 
 
 
377 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  30.99 
 
 
377 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  29.51 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  28.29 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  27.85 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  28.48 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  30 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  30 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  30 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  30 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  30 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  30 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  27.85 
 
 
346 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.8 
 
 
357 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.8 
 
 
357 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.8 
 
 
357 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.8 
 
 
357 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.8 
 
 
357 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  28.48 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  28.48 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  28.48 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  28.48 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  27.67 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  26.01 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  25.58 
 
 
363 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  26.4 
 
 
364 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  24.56 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  26.16 
 
 
363 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  26.86 
 
 
361 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  26.86 
 
 
361 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  26.86 
 
 
361 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  26.16 
 
 
363 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  26.16 
 
 
363 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  26.16 
 
 
363 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  25.58 
 
 
363 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  25.58 
 
 
363 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  25.14 
 
 
379 aa  61.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  23.53 
 
 
391 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  25.58 
 
 
583 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  24.71 
 
 
376 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  24.71 
 
 
365 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1050  transposase  46.67 
 
 
62 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  27.16 
 
 
364 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  28.37 
 
 
366 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  23.3 
 
 
374 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  23.21 
 
 
353 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  23.95 
 
 
356 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  21.82 
 
 
351 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3320  putative transposase  25.57 
 
 
362 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  25.34 
 
 
354 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  24.66 
 
 
356 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  28.57 
 
 
361 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  28.57 
 
 
361 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  22.91 
 
 
363 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  22.64 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  22.7 
 
 
353 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4275  integrase catalytic subunit  22.7 
 
 
353 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646114  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 
353 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28.86 
 
 
363 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  28.86 
 
 
363 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  28.86 
 
 
363 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  28.86 
 
 
363 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  28.86 
 
 
363 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  25.88 
 
 
351 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  23.33 
 
 
365 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2522  integrase catalytic subunit  22.7 
 
 
353 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>