More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2588 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  64.03 
 
 
560 aa  721    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  67.5 
 
 
564 aa  796    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  69.41 
 
 
567 aa  810    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  74.33 
 
 
568 aa  843    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
591 aa  1205    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  58.47 
 
 
566 aa  670    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 
557 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 
566 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 
565 aa  425  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  39.79 
 
 
590 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
591 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 
577 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  41.24 
 
 
559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
569 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.47 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 
539 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 
549 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.46 
 
 
563 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.64 
 
 
563 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.46 
 
 
563 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  39.4 
 
 
583 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.64 
 
 
561 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.46 
 
 
582 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.46 
 
 
563 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.78 
 
 
561 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.57 
 
 
582 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.39 
 
 
561 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.1 
 
 
561 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 
561 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
584 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.5 
 
 
583 aa  381  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 
573 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 
551 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.81 
 
 
585 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
558 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
564 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
584 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
575 aa  363  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
543 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
560 aa  359  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 
549 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  35.36 
 
 
569 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  35.16 
 
 
569 aa  344  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 
569 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 
572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
585 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 
562 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
588 aa  336  7e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 
557 aa  336  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.39 
 
 
555 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
559 aa  335  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.61 
 
 
577 aa  335  2e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 
559 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 
562 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.43 
 
 
572 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 
562 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
577 aa  334  3e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
561 aa  334  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.68 
 
 
562 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
544 aa  333  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 
577 aa  332  8e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
549 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 
577 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 
557 aa  329  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 
557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
559 aa  328  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.43 
 
 
557 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
553 aa  327  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
574 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.59 
 
 
557 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
557 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.41 
 
 
557 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
561 aa  327  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  35.12 
 
 
560 aa  326  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 
563 aa  326  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
562 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
562 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.78 
 
 
563 aa  326  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.28 
 
 
555 aa  325  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.9 
 
 
557 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 
557 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.84 
 
 
561 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
561 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
549 aa  324  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
553 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 
557 aa  324  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
583 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.12 
 
 
557 aa  324  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 
583 aa  323  4e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  35.66 
 
 
561 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  35.66 
 
 
561 aa  323  5e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 
561 aa  323  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 
561 aa  323  5e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 
561 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 
561 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 
561 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>