98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2556 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 261 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  59.77 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  54.79 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  46.92 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2037  recombination protein O, RecO  50.38 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0117854  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  42.47 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0203  DNA repair protein RecO  41 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  36.72 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  26.43 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0462  DNA repair protein RecO  31.82 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  24 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  24.3 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  26.92 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1197  DNA repair protein RecO  35 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  29.82 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0459  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4044  DNA repair protein RecO  30.07 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  22.98 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3301  DNA replication and repair protein RecO  29.94 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.729865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  24.17 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  24.74 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  25.77 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1264  DNA repair protein RecO  26.13 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  22.18 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  27.64 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  24.87 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  29.19 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.36 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02500  possible DNA repair protein RecO  29.22 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  23.96 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  24.15 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0984  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.444728  normal  0.0717159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  23.79 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  23.85 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  25.55 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  24.35 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  24.35 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  23.81 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  20.97 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  27.85 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  23.67 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  21.76 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1674  hypothetical protein  28.99 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.515163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  22.4 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  25.13 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  22.8 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  22.8 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  22.8 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  23.77 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  22.4 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  24.35 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  26.15 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  23.58 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  24.37 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0333  DNA repair protein RecO  25.45 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  21.65 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  23.87 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  23.74 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  26.4 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0790  DNA repair protein RecO  24.69 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000558246  normal  0.055878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0706  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 237 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  23.12 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  24.37 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  28.12 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  23.39 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  21.24 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  23.08 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  26.11 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  24.6 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  26.15 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  25.37 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  24.89 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  21.28 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  20.65 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  22.77 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  22.37 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0914  DNA repair protein RecO  21.92 
 
 		 250 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1386  DNA repair protein RecO  28.57 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.810395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2009  DNA repair protein RecO, putative  25.81 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  22.16 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  21.31 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  24.73 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  26.79 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  22.8 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  26.88 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  29.59 
 
 		 676 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>