More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2551 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  55.47 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  55.23 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  43.12 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.71 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  28.87 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  26.67 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.9 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.91 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  25.44 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  27.84 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  26.64 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.42 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.82 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  30.24 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.37 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.18 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  31.65 
 
 		 149 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.43 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.21 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  26.78 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.94 
 
 		 144 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 151 aa  72  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  22.55 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  38.73 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  32.21 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.24 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.17 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.29 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  33.57 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  32.87 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  33.09 
 
 		 159 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  33.1 
 
 		 158 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.09 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.73 
 
 		 159 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.67 
 
 		 151 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.28 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.61 
 
 		 138 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.86 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  26.07 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.79 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  24.07 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  30.99 
 
 		 152 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.75 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  24.75 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  24.32 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  30.56 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.25 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  35.46 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30.77 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30.77 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  29.86 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  24.39 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  30.56 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.65 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  22.53 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  23.57 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.82 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.47 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  22.15 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.66 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  31.69 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.1 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.07 
 
 		 153 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.69 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.43 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.3 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  31.51 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.5 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  24.72 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.76 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  24.83 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  24.91 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.93 
 
 		 139 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>