More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2536 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  45.95 
 
 
1137 aa  933  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  55.29 
 
 
601 aa  645  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.02471e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  45.66 
 
 
1100 aa  890  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  62.48 
 
 
553 aa  736  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  46.66 
 
 
1061 aa  942  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  44.09 
 
 
1098 aa  808  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  49.55 
 
 
1088 aa  1028  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  57.7 
 
 
572 aa  667  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  60.63 
 
 
548 aa  696  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  45.93 
 
 
1136 aa  938  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  49.95 
 
 
1088 aa  1023  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  45.45 
 
 
1106 aa  946  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  52.47 
 
 
1108 aa  1146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  45.13 
 
 
1105 aa  939  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  48.87 
 
 
1092 aa  1021  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  48.14 
 
 
1088 aa  1005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  46.22 
 
 
1137 aa  939  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  45.77 
 
 
1137 aa  926  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  45.45 
 
 
1106 aa  946  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  44.41 
 
 
1101 aa  938  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  46.43 
 
 
1110 aa  943  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  45.66 
 
 
1100 aa  887  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  46.22 
 
 
1137 aa  938  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  59.18 
 
 
556 aa  682  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  51.62 
 
 
1121 aa  1144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  100 
 
 
1098 aa  2281  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  58.3 
 
 
571 aa  671  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  55.76 
 
 
596 aa  653  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  45.56 
 
 
1142 aa  951  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  44.48 
 
 
1131 aa  906  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  44.48 
 
 
1131 aa  906  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  47.64 
 
 
1102 aa  998  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  44.48 
 
 
1131 aa  905  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  44.72 
 
 
1131 aa  910  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  55.76 
 
 
596 aa  653  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  44.48 
 
 
1131 aa  906  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  47.7 
 
 
1102 aa  998  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  46.11 
 
 
1100 aa  930  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  8.83241e-07 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  50.95 
 
 
1123 aa  1126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  45.31 
 
 
1094 aa  945  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  45.84 
 
 
1152 aa  939  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  45.95 
 
 
1109 aa  959  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  44.92 
 
 
1093 aa  936  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  45.24 
 
 
1164 aa  936  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  53.1 
 
 
1116 aa  1184  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  53 
 
 
1113 aa  1171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  57.87 
 
 
604 aa  674  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  52.17 
 
 
1109 aa  1121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  56.12 
 
 
582 aa  648  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.1423e-06  hitchhiker  2.15015e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  51.15 
 
 
1139 aa  1140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  59.07 
 
 
601 aa  677  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  63.45 
 
 
551 aa  742  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  56.86 
 
 
567 aa  669  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  49.41 
 
 
1114 aa  1083  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  57.43 
 
 
610 aa  668  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  57.49 
 
 
964 aa  649  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  55.25 
 
 
591 aa  646  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  58.55 
 
 
577 aa  681  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  45.48 
 
 
1108 aa  944  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  46.19 
 
 
1100 aa  973  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  48.77 
 
 
1088 aa  1023  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  45.97 
 
 
1154 aa  941  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  45.24 
 
 
1164 aa  936  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  45.06 
 
 
1101 aa  935  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  80.71 
 
 
1099 aa  1865  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  65.91 
 
 
1105 aa  1526  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  44.81 
 
 
1100 aa  966  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  67.15 
 
 
1105 aa  1568  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  76.16 
 
 
1098 aa  1802  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  60.96 
 
 
553 aa  726  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  53.46 
 
 
1116 aa  1191  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  45.76 
 
 
1093 aa  946  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  44.51 
 
 
1085 aa  893  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  48.79 
 
 
1130 aa  1058  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  49.95 
 
 
1088 aa  1023  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  53.45 
 
 
1119 aa  1171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  60.96 
 
 
572 aa  725  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  57.8 
 
 
551 aa  693  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  59.45 
 
 
682 aa  690  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  45.38 
 
 
1100 aa  949  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  55.33 
 
 
556 aa  637  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  45.21 
 
 
1112 aa  970  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  73.7 
 
 
1098 aa  1718  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  46.22 
 
 
1137 aa  938  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  49.5 
 
 
1110 aa  1119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  46.05 
 
 
1108 aa  953  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  55.76 
 
 
596 aa  653  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  47.58 
 
 
1121 aa  1008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  52.79 
 
 
1112 aa  1165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  44.39 
 
 
1131 aa  904  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  49.51 
 
 
1108 aa  1080  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  45.34 
 
 
1134 aa  926  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  56.01 
 
 
574 aa  650  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  60.77 
 
 
572 aa  725  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  46.58 
 
 
1100 aa  982  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  44.44 
 
 
1088 aa  941  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  45.34 
 
 
1100 aa  958  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  43.14 
 
 
1100 aa  909  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  45.25 
 
 
1160 aa  936  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  46.14 
 
 
1154 aa  936  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>