More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2520 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
304 aa  621  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  66.11 
 
 
301 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
304 aa  407  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.51 
 
 
305 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.18 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.13 
 
 
302 aa  394  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.47 
 
 
302 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3037  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.83 
 
 
305 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2949  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.59 
 
 
303 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1334  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.93 
 
 
303 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2152  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.79 
 
 
302 aa  371  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000659142  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1712  electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.74 
 
 
304 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.817831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3301  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.15 
 
 
304 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.53 
 
 
307 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
307 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.28 
 
 
307 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.24 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  37.38 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.74 
 
 
325 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.01 
 
 
307 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.19 
 
 
314 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.68 
 
 
307 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.45 
 
 
327 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.1 
 
 
309 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.77 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0463  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.33 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.24 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.69 
 
 
309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.53 
 
 
326 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.11 
 
 
325 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.37 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.99 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.95 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.68 
 
 
325 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  36.68 
 
 
325 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.68 
 
 
325 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.26 
 
 
309 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.36 
 
 
325 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.36 
 
 
325 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.36 
 
 
325 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.36 
 
 
325 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.68 
 
 
325 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.33 
 
 
325 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.52 
 
 
308 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  35.37 
 
 
311 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.12 
 
 
339 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.94 
 
 
313 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  35.05 
 
 
309 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.05 
 
 
309 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.19 
 
 
313 aa  169  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.94 
 
 
319 aa  168  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.4 
 
 
325 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.75 
 
 
333 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.54 
 
 
309 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2265  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.54 
 
 
322 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0896895  hitchhiker  0.0000142262 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.74 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.69 
 
 
307 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.29 
 
 
308 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.06 
 
 
317 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.58 
 
 
311 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.26 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.28 
 
 
314 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.76 
 
 
317 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.78 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.02 
 
 
399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.26 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.62 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.16 
 
 
308 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.92 
 
 
308 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.62 
 
 
312 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4277  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.29 
 
 
342 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.71 
 
 
317 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.69 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.29 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.11 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.42 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.26 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.19 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.26 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.01 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.9 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.9 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.99 
 
 
311 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.11 
 
 
309 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
335 aa  162  4.0000000000000004e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.62 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06699  electron transfer flavoprotein alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05470)  34.19 
 
 
349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.68 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.24 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.03 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.89 
 
 
309 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.73 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.46 
 
 
311 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.33 
 
 
309 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.46 
 
 
311 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.33 
 
 
317 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  35.46 
 
 
311 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.38 
 
 
328 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.85 
 
 
314 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>