More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2424 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
103 aa  209  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  97.09 
 
 
103 aa  206  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  98.06 
 
 
103 aa  206  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  97.09 
 
 
103 aa  205  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  97.09 
 
 
103 aa  205  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  93.2 
 
 
103 aa  199  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2297  30S ribosomal protein S10  94.17 
 
 
102 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238807  hitchhiker  0.00325794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
103 aa  142  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  67 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  68.37 
 
 
101 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  65.31 
 
 
101 aa  136  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
101 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
101 aa  136  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  66.33 
 
 
101 aa  135  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 
101 aa  135  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  67.35 
 
 
101 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  61.62 
 
 
101 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  61 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  58.82 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  62.24 
 
 
101 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  55 
 
 
102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  61 
 
 
102 aa  130  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  57.84 
 
 
103 aa  129  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  57 
 
 
102 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  57.58 
 
 
102 aa  129  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
102 aa  130  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  56.57 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  58 
 
 
102 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  58 
 
 
107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  54.9 
 
 
104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  60 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  54.9 
 
 
103 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
102 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  55.56 
 
 
102 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  58.82 
 
 
103 aa  127  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  62.89 
 
 
101 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
103 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
102 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
104 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
104 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1419  ribosomal protein S10  56.31 
 
 
117 aa  127  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
104 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  57 
 
 
102 aa  126  9.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  57 
 
 
102 aa  126  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  61.86 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
102 aa  126  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0078  30S ribosomal protein S10  59 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0955651 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  56 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  57 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
102 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  57 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  53.92 
 
 
104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  57.58 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  56.12 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  54 
 
 
103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0679  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  56.57 
 
 
105 aa  124  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  55.1 
 
 
102 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  55.1 
 
 
102 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04522  30S ribosomal protein S10  52.94 
 
 
104 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000034971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  54.55 
 
 
103 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>