More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2423 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  87.08 
 
 		 209 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  80.86 
 
 		 209 aa  354  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  78.95 
 
 		 209 aa  347  5e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 209 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  70.33 
 
 		 209 aa  318  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 209 aa  306  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  56.59 
 
 		 205 aa  234  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  218  7e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 205 aa  214  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 222 aa  201  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  48.26 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  45.93 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  43.69 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  45.41 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  46.5 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 214 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  45.36 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  43.07 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  47 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  43.2 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  43.2 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  43 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 212 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  43.69 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  43.2 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  45.08 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  43.54 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  42.79 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  42.58 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  45.32 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  44.61 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  43.37 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  44.28 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  43.28 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0337  50S ribosomal protein L3  43 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000773756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  42.72 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  44.06 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  42.31 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  41.09 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000332087  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  44.66 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>