259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2405 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2405  50S ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137776  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0307  50S ribosomal protein L30  85 
 
 		 66 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0473987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2211  50S ribosomal protein L30  85 
 
 		 61 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000289447  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  83.33 
 
 		 61 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2046  50S ribosomal protein L30  76.67 
 
 		 62 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00780916  normal  0.406407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2278  50S ribosomal protein L30  81.97 
 
 		 61 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000449635  hitchhiker  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1833  50S ribosomal protein L30  76.27 
 
 		 63 aa  93.6  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.188636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  60.71 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  58.93 
 
 		 59 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  57.14 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 62 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0733  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5142  ribosomal protein L30  57.14 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3804  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00029637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  53.57 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  50.91 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3618  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0346  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0149627  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  61.4 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 58 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3733  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000176157  hitchhiker  0.00372314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3618  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00151537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23290  LSU ribosomal protein L30P  56.14 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0884067  hitchhiker  0.00000565029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  49.15 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  48.33 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  53.57 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  45.76 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4526  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000879323  hitchhiker  0.000148464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0776  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000050093  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0301  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000735954  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  49.09 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3896  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1340  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5029  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000128267  normal  0.550586 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  51.79 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4672  ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000104117  unclonable  0.00000000820737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  50.91 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1889  50S ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  51.79 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0645  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  47.37 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  45 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>