More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2350 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1053 aa  2176    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
926 aa  618  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1287 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
791 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1029 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.28 
 
 
1560 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1407 aa  355  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1313 aa  353  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
902 aa  348  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1064 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
1116 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
1101 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
927 aa  296  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 
1611 aa  294  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 
1452 aa  293  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 
1578 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
827 aa  289  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
1177 aa  288  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.61 
 
 
1079 aa  286  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
1363 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
1788 aa  285  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1222 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.95 
 
 
763 aa  276  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
947 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
911 aa  274  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
1596 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
767 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
756 aa  270  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1275 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
781 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
959 aa  267  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
882 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
1044 aa  263  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
957 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  28.21 
 
 
823 aa  262  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
1132 aa  262  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.25 
 
 
1442 aa  263  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
969 aa  262  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
989 aa  261  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
674 aa  261  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1433 aa  261  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
1229 aa  260  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
841 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
778 aa  259  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
738 aa  259  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
1007 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
939 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1358 aa  258  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
780 aa  257  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1033 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1260 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
1078 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1260 aa  254  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
1055 aa  254  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
952 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
957 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
1131 aa  252  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 
989 aa  252  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  33.27 
 
 
943 aa  251  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
803 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  37.69 
 
 
758 aa  251  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
1075 aa  250  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
868 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
901 aa  249  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1044 aa  249  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1350 aa  248  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.17 
 
 
853 aa  248  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
940 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1350 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
881 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
894 aa  247  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.530834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
969 aa  246  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1203 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 
1202 aa  246  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
995 aa  245  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.33 
 
 
1223 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
916 aa  244  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
865 aa  244  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
1051 aa  244  7.999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  31.99 
 
 
810 aa  244  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
877 aa  243  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
878 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
898 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
902 aa  243  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 
1059 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1255 aa  243  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  29.95 
 
 
853 aa  243  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.47 
 
 
1193 aa  243  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
785 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
853 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
1157 aa  241  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  34.92 
 
 
666 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
1000 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1127 aa  240  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
1309 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
968 aa  240  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
863 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  33.72 
 
 
764 aa  239  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
1313 aa  239  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
973 aa  239  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>