167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2348 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1971 aa  3787    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  38.03 
 
 		 3506 aa  367  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  40.24 
 
 		 2396 aa  364  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.88 
 
 		 3629 aa  347  8.999999999999999e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  40.55 
 
 		 2365 aa  320  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  40.55 
 
 		 2346 aa  320  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.31 
 
 		 1197 aa  320  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.12 
 
 		 2906 aa  316  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1881 aa  310  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1530 aa  261  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  37.81 
 
 		 2366 aa  259  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  39.39 
 
 		 1508 aa  233  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 		 2578 aa  217  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  41.71 
 
 		 3391 aa  213  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.81 
 
 		 3322 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.27 
 
 		 2711 aa  207  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  39.67 
 
 		 2371 aa  202  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.09 
 
 		 1532 aa  200  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  36.55 
 
 		 4238 aa  198  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  37.52 
 
 		 4238 aa  183  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  35.7 
 
 		 1882 aa  181  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  37.16 
 
 		 1458 aa  171  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  36.6 
 
 		 3954 aa  171  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  40.17 
 
 		 1782 aa  169  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  35.47 
 
 		 1459 aa  168  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  44.81 
 
 		 1741 aa  166  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.54 
 
 		 1119 aa  152  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  37.81 
 
 		 1130 aa  146  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.6 
 
 		 3822 aa  143  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.39 
 
 		 1113 aa  139  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  31.04 
 
 		 1550 aa  136  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.46 
 
 		 1322 aa  135  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.24 
 
 		 3089 aa  126  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  34.07 
 
 		 2926 aa  122  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  33.06 
 
 		 1172 aa  121  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 3420 aa  119  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.88 
 
 		 1357 aa  119  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  34.59 
 
 		 1111 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.38 
 
 		 3415 aa  117  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  35.22 
 
 		 1861 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  41.63 
 
 		 1180 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  31.68 
 
 		 2642 aa  113  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  34.1 
 
 		 950 aa  112  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.98 
 
 		 2003 aa  111  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.58 
 
 		 2057 aa  111  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  40.45 
 
 		 1108 aa  108  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 		 825 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1632 aa  102  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  25.92 
 
 		 819 aa  99  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0259  Outer membrane autotransporter barrel  27.83 
 
 		 940 aa  98.6  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  32.66 
 
 		 2407 aa  98.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  31.54 
 
 		 852 aa  97.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  32.29 
 
 		 1806 aa  95.9  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  33.55 
 
 		 861 aa  94.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  33.99 
 
 		 1571 aa  91.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1300 aa  91.3  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  44.24 
 
 		 1099 aa  89.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.51 
 
 		 994 aa  89.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.33 
 
 		 1285 aa  89.4  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  26.79 
 
 		 909 aa  88.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.16 
 
 		 1694 aa  87.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.05 
 
 		 2363 aa  83.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44.62 
 
 		 1055 aa  83.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  38.32 
 
 		 1078 aa  83.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  27.41 
 
 		 924 aa  82.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.67 
 
 		 1029 aa  82.4  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.87 
 
 		 1081 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.09 
 
 		 1848 aa  80.1  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.95 
 
 		 1593 aa  79.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  35.94 
 
 		 1093 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  35.94 
 
 		 1093 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.45 
 
 		 947 aa  76.3  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  38.68 
 
 		 1115 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.48 
 
 		 1227 aa  74.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  26.12 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.79 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  28.79 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  28.79 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 		 955 aa  71.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.4 
 
 		 818 aa  72  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  40.26 
 
 		 995 aa  70.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  39.69 
 
 		 986 aa  69.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  29.17 
 
 		 3504 aa  69.3  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  28.02 
 
 		 961 aa  67  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  27.16 
 
 		 1049 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.98 
 
 		 3015 aa  67  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  43.14 
 
 		 1333 aa  65.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.98 
 
 		 730 aa  64.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  30.69 
 
 		 864 aa  64.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  33.33 
 
 		 641 aa  63.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  40.94 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.43 
 
 		 1011 aa  62.4  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  22.99 
 
 		 927 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  26.02 
 
 		 1268 aa  62  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  45.69 
 
 		 652 aa  62  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.76 
 
 		 1039 aa  61.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  47.89 
 
 		 860 aa  61.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  25.42 
 
 		 948 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  31.55 
 
 		 1869 aa  61.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.5 
 
 		 638 aa  60.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>