More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2326 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.4 
 
 
1415 aa  775    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.85 
 
 
3954 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  55.7 
 
 
2133 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  54.12 
 
 
2807 aa  964    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
2467 aa  4690    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  46.06 
 
 
2198 aa  594  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 
4334 aa  572  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  35.15 
 
 
3026 aa  452  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  44.09 
 
 
1764 aa  441  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  40.07 
 
 
1134 aa  417  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.91 
 
 
1855 aa  399  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  40.23 
 
 
1133 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.41 
 
 
3209 aa  365  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.67 
 
 
2954 aa  355  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 
2097 aa  343  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.79 
 
 
1145 aa  316  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 
907 aa  305  7.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  30.92 
 
 
1582 aa  298  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.4 
 
 
1390 aa  268  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  28.06 
 
 
1628 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  45.69 
 
 
768 aa  252  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 
851 aa  252  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  44.62 
 
 
395 aa  248  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  43.82 
 
 
395 aa  243  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.26 
 
 
2911 aa  238  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  30.04 
 
 
1400 aa  229  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.82 
 
 
1884 aa  224  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 
1079 aa  223  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28 
 
 
4800 aa  222  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  34.98 
 
 
1534 aa  221  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  30.86 
 
 
901 aa  220  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  31.9 
 
 
858 aa  219  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 
1532 aa  214  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  29.93 
 
 
889 aa  212  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  38.3 
 
 
1933 aa  205  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  36.23 
 
 
2950 aa  204  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  28.83 
 
 
1213 aa  201  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.09 
 
 
3608 aa  193  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.34 
 
 
1029 aa  191  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  52.34 
 
 
1029 aa  191  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  42.82 
 
 
1197 aa  189  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  40.41 
 
 
820 aa  189  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  43.98 
 
 
2701 aa  186  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.84 
 
 
824 aa  185  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  37.68 
 
 
1610 aa  184  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.05 
 
 
3619 aa  179  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.29 
 
 
3619 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.95 
 
 
833 aa  173  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  34.89 
 
 
8871 aa  171  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  36.34 
 
 
1610 aa  170  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.69 
 
 
1363 aa  164  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.81 
 
 
946 aa  161  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.47 
 
 
1279 aa  160  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 
2836 aa  158  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  35.18 
 
 
462 aa  152  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  34.91 
 
 
1100 aa  149  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  27.2 
 
 
1156 aa  148  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  36.06 
 
 
503 aa  147  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  35.76 
 
 
503 aa  144  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.17 
 
 
1499 aa  143  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  26.35 
 
 
1895 aa  142  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  28.25 
 
 
1544 aa  141  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.86 
 
 
965 aa  140  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  37.72 
 
 
727 aa  136  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.05 
 
 
2689 aa  132  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  34.22 
 
 
1112 aa  131  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.61 
 
 
1286 aa  127  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 
475 aa  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  34.66 
 
 
648 aa  127  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.06 
 
 
2678 aa  127  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.61 
 
 
556 aa  126  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.58 
 
 
574 aa  126  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  26.91 
 
 
1480 aa  126  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.8 
 
 
467 aa  126  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  27.9 
 
 
1164 aa  125  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.98 
 
 
475 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  29.13 
 
 
665 aa  123  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 
1072 aa  122  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  31.12 
 
 
448 aa  121  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.07 
 
 
595 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  38.49 
 
 
452 aa  120  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.48 
 
 
1795 aa  120  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  33.22 
 
 
486 aa  120  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  24.45 
 
 
14829 aa  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.15 
 
 
3598 aa  116  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  34.26 
 
 
864 aa  115  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  28.97 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.45 
 
 
980 aa  112  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.8 
 
 
1019 aa  112  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  28.12 
 
 
860 aa  112  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.62 
 
 
2667 aa  112  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  25.7 
 
 
1168 aa  110  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.67 
 
 
745 aa  110  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.83 
 
 
1112 aa  109  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  49.41 
 
 
1055 aa  108  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  30.94 
 
 
1424 aa  107  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.34 
 
 
2775 aa  106  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.19 
 
 
855 aa  105  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  24.09 
 
 
2245 aa  104  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  34.15 
 
 
341 aa  103  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>