104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2220 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2220  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  3.76719e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  67.83 
 
 
161 aa  179  3e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  67.83 
 
 
161 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  67.83 
 
 
161 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  67.83 
 
 
161 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1699  transposase IS3/IS911 family protein  70.63 
 
 
161 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  4.51085e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0650  transposase IS3/IS911 family protein  71.33 
 
 
161 aa  161  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.124888  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  37.14 
 
 
160 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.00064e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  37.14 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.52425e-06  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  34.01 
 
 
157 aa  72.4  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 
157 aa  71.6  6e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 
174 aa  70.1  2e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  34.81 
 
 
148 aa  70.1  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.38924e-07  decreased coverage  2.08115e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 
174 aa  70.1  2e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  33.33 
 
 
145 aa  70.1  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  33.33 
 
 
157 aa  70.1  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  31.79 
 
 
165 aa  67.4  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.55993e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  33.58 
 
 
162 aa  63.2  2e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  63.5  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  41.24 
 
 
94 aa  62.4  4e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1740  putative transposase  37.5 
 
 
161 aa  61.6  7e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.704353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  38.68 
 
 
125 aa  60.5  2e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2203  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0499137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3026  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3317  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3927  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4344  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4366  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  58.5  6e-08  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  35.14 
 
 
171 aa  56.6  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 
163 aa  55.8  4e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 
163 aa  55.8  4e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 
163 aa  55.8  4e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  35.21 
 
 
163 aa  55.8  4e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 
163 aa  55.5  5e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  33.56 
 
 
163 aa  53.5  2e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  33.56 
 
 
163 aa  53.5  2e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  33.79 
 
 
163 aa  51.2  8e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  31.58 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  35.86 
 
 
166 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  33.57 
 
 
163 aa  49.7  3e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  38.26 
 
 
166 aa  48.9  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
166 aa  48.1  7e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  34.04 
 
 
151 aa  48.1  8e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 
165 aa  47.8  9e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  34.81 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  34.81 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  31.65 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2333  hypothetical protein  30.95 
 
 
111 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>