19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2209 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2209  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1558  hypothetical protein  41.15 
 
 
224 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0299  hypothetical protein  39.09 
 
 
221 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153747  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3540  hypothetical protein  37.09 
 
 
211 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1042  hypothetical protein  35.12 
 
 
208 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0790  hypothetical protein  40.4 
 
 
162 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0996  CRISPR-associated protein, Csm2 family  31.88 
 
 
220 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.462721  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7389  hypothetical protein  27.36 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12610  hypothetical protein  31.43 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2063  hypothetical protein  28.7 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.336699  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1293  hypothetical protein  32.54 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.464309  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0078  hypothetical protein  30.45 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1567  hypothetical protein  48.57 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2149  abortive phage resistance protein  30.2 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.744102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11633  hypothetical protein  30.83 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.389497  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2869  hypothetical protein  25.23 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3792  abortive phage resistance protein-like  26.94 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1919  abortive phage resistance protein-like  25.93 
 
 
198 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000352931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4360  hypothetical protein  27.37 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>