122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2207 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  96.15 
 
 
321 aa  154  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  96.15 
 
 
321 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  96.15 
 
 
321 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  96.15 
 
 
321 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  96.15 
 
 
327 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  96.15 
 
 
160 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  96.15 
 
 
112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  89.74 
 
 
321 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  87.18 
 
 
321 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  80.77 
 
 
321 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  80.77 
 
 
321 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  75.64 
 
 
319 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  76.92 
 
 
321 aa  124  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  74.36 
 
 
321 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  73.08 
 
 
321 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  73.08 
 
 
316 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  71.79 
 
 
295 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  71.79 
 
 
323 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  67.95 
 
 
97 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  71.79 
 
 
325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  66.67 
 
 
321 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  70.51 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  65.38 
 
 
324 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  66.67 
 
 
327 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  67.95 
 
 
101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  61.54 
 
 
324 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  62.82 
 
 
320 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  62.82 
 
 
336 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  61.54 
 
 
325 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  61.54 
 
 
325 aa  104  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  62.82 
 
 
333 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  67.61 
 
 
72 aa  100  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2238  hypothetical protein  88.24 
 
 
70 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  48.72 
 
 
340 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  47.44 
 
 
335 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1785  hypothetical protein  52.11 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  46.15 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  46.15 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  41.03 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  41.03 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  50.75 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  44.3 
 
 
323 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2253  hypothetical protein  62.26 
 
 
53 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.353665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1503  hypothetical protein  62 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2223  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126259  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  39.74 
 
 
326 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  39.74 
 
 
252 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  46.15 
 
 
323 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0719  protein of unknown function DUF1568  43.04 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.146738  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  40.28 
 
 
336 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  43.42 
 
 
250 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2215  hypothetical protein  62.5 
 
 
66 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.29673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  37.66 
 
 
321 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  32.43 
 
 
258 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  37.18 
 
 
318 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  38.16 
 
 
316 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  34.62 
 
 
315 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  30.77 
 
 
253 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  30.77 
 
 
253 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2180  hypothetical protein  83.33 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  36.92 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  35.53 
 
 
314 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  35.06 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  32.05 
 
 
251 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  64.1 
 
 
288 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  36.62 
 
 
216 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  38.36 
 
 
316 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  38.46 
 
 
313 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  37.8 
 
 
236 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  34.21 
 
 
312 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  36.23 
 
 
230 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  40 
 
 
234 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  34.62 
 
 
245 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  36.23 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  34.57 
 
 
289 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  36.23 
 
 
230 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  39.06 
 
 
236 aa  48.9  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  30.77 
 
 
287 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  32.84 
 
 
232 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2885  hypothetical protein  35.9 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  32.88 
 
 
305 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  41.18 
 
 
236 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  36.23 
 
 
230 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  36.23 
 
 
230 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  32.84 
 
 
287 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  37.66 
 
 
248 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  37.66 
 
 
248 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  31.58 
 
 
312 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1812  protein of unknown function DUF1568  32.88 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.001052  hitchhiker  0.000000000744567 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  32.84 
 
 
288 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  32.84 
 
 
288 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  31.17 
 
 
323 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  31.17 
 
 
241 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  34.57 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  32.05 
 
 
282 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1811  protein of unknown function DUF1568  32.88 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00808567  hitchhiker  0.000000000975496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0267  transposase and inactivated derivatives  32.1 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  32.47 
 
 
319 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>