99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2153 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  809    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  73.07 
 
 
417 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  63.91 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  59.24 
 
 
408 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  31.75 
 
 
383 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  31.15 
 
 
381 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  28.08 
 
 
377 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  30.29 
 
 
379 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  28.54 
 
 
387 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  32.8 
 
 
395 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  31.84 
 
 
389 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  25.88 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  30.94 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.83 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  26.41 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  32.64 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  29.5 
 
 
395 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  29.91 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25.92 
 
 
396 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  28.61 
 
 
1101 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.14 
 
 
402 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  27.64 
 
 
387 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  28.87 
 
 
416 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  27.37 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  23.46 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  31.16 
 
 
1852 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  24.08 
 
 
396 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  24.54 
 
 
396 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  27.01 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  25.7 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  24.81 
 
 
467 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  24.87 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.16 
 
 
400 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  26.42 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  24.29 
 
 
468 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  24.88 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  24.55 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.19 
 
 
932 aa  70.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  25.26 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  26.46 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  26.76 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  25 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  25 
 
 
392 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  25 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  27.75 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  22.62 
 
 
501 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  27.27 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  25.4 
 
 
464 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  21.32 
 
 
933 aa  62.4  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  26.17 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  25.3 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  21.86 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.7 
 
 
934 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  24.68 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  21.69 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  21.52 
 
 
931 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  24.37 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  21.99 
 
 
512 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  25.57 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  25.35 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  25.35 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  26.2 
 
 
404 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  24.23 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  26.51 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  26.61 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  22.75 
 
 
399 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  20.45 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  28.76 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  23.04 
 
 
806 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  22.05 
 
 
382 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  22.48 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  24.32 
 
 
392 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  21.81 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  23.25 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  25.97 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  22.69 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  24.58 
 
 
390 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  27.24 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  20.06 
 
 
629 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  22.87 
 
 
386 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  22.87 
 
 
386 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  26.58 
 
 
386 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  22.67 
 
 
389 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  23.76 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  25.36 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  24.29 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  27.81 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  25.79 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  24.88 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  25.84 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  23.5 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  28.5 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  27.68 
 
 
398 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  21.22 
 
 
391 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  22.22 
 
 
385 aa  43.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>