204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2131 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2131  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.132605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  79.38 
 
 
320 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2218  hypothetical protein  60.19 
 
 
327 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00293328  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1423  protein of unknown function DUF1568  60.19 
 
 
325 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1487  hypothetical protein  60.31 
 
 
323 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  59.06 
 
 
336 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  57.19 
 
 
506 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1386  protein of unknown function DUF1568  57.5 
 
 
325 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1484  hypothetical protein  61.09 
 
 
295 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1256  protein of unknown function DUF1568  56.88 
 
 
321 aa  360  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0072967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0722  protein of unknown function DUF1568  54.23 
 
 
321 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1319  protein of unknown function DUF1568  54.23 
 
 
319 aa  348  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0490388  hitchhiker  0.00690567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2333  protein of unknown function DUF1568  51.67 
 
 
324 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1506  protein of unknown function DUF1568  53.61 
 
 
321 aa  340  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0255  hypothetical protein  58.63 
 
 
288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0724188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2233  hypothetical protein  53.29 
 
 
321 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2246  hypothetical protein  53.29 
 
 
321 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2237  hypothetical protein  53.29 
 
 
321 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1356  protein of unknown function DUF1568  53.29 
 
 
321 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0875577  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2213  hypothetical protein  52.98 
 
 
321 aa  329  4e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.809495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1427  hypothetical protein  50.47 
 
 
321 aa  328  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1425  hypothetical protein  50.16 
 
 
321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2204  hypothetical protein  54.05 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2454  protein of unknown function DUF1568  51.86 
 
 
321 aa  325  9e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2336  protein of unknown function DUF1568  49.38 
 
 
324 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1929  protein of unknown function DUF1568  51.4 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  50.62 
 
 
325 aa  318  9e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1578  hypothetical protein  47.52 
 
 
316 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000706252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  46.65 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  45.62 
 
 
338 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  43.07 
 
 
340 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  41.07 
 
 
335 aa  250  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0845  hypothetical protein  44.75 
 
 
334 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1791  transposase and inactivated derivatives  43.77 
 
 
323 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  41.12 
 
 
323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0954  hypothetical protein  40.55 
 
 
326 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.729066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2205  hypothetical protein  66.45 
 
 
160 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  51.16 
 
 
180 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0922  protein of unknown function DUF1568  51.45 
 
 
176 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0950  hypothetical protein  35.88 
 
 
321 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000190963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  32.18 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  38.97 
 
 
314 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  35.71 
 
 
318 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  42.25 
 
 
305 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  41.71 
 
 
282 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  29.68 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  40 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  39.67 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  35.04 
 
 
315 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  34.01 
 
 
319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2224  hypothetical protein  59.05 
 
 
112 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00479916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3632  hypothetical protein  29.69 
 
 
316 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.108416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  31.1 
 
 
312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  34.91 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2247  hypothetical protein  64.84 
 
 
101 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1032  protein of unknown function DUF1568  37.02 
 
 
326 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2878  protein of unknown function DUF1568  37.16 
 
 
289 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000473385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1406  protein of unknown function DUF1568  37.7 
 
 
289 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  40.98 
 
 
277 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  33.47 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  29.71 
 
 
288 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  33.47 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2198  transposase  31.52 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  36.46 
 
 
288 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  40.97 
 
 
250 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0167  hypothetical protein  53.47 
 
 
101 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  29.07 
 
 
288 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  26.18 
 
 
253 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2878  protein of unknown function DUF1568  28.62 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2086  hypothetical protein  37.78 
 
 
321 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.464464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  33.93 
 
 
231 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  34.87 
 
 
236 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  36.09 
 
 
236 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4538  protein of unknown function DUF1568  31.52 
 
 
251 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0855967  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2050  protein of unknown function DUF1568  37.65 
 
 
336 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.633564  normal  0.705399 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0595  hypothetical protein  26.21 
 
 
258 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.217159  hitchhiker  2.03187e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  34.86 
 
 
231 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12790  transposase  37.23 
 
 
241 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  34.95 
 
 
232 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0741  protein of unknown function DUF1568  53.85 
 
 
97 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117883  normal  0.0672697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2207  hypothetical protein  62.82 
 
 
81 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  33.98 
 
 
239 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  34.97 
 
 
234 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  37.75 
 
 
234 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  33.03 
 
 
234 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  32.16 
 
 
232 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2216  hypothetical protein  63.38 
 
 
72 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.136455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  33.61 
 
 
230 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  31.28 
 
 
236 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.81 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  37.24 
 
 
235 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  31.93 
 
 
252 aa  96.7  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  35.71 
 
 
226 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  37.59 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  37.59 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01210  transposase  31.84 
 
 
245 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  36.05 
 
 
216 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  38.62 
 
 
287 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  34.31 
 
 
304 aa  94  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  35.48 
 
 
232 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>