More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2072 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.35 
 
 
700 aa  638  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.81 
 
 
706 aa  969  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.69 
 
 
712 aa  857  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.4 
 
 
706 aa  858  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  58 
 
 
719 aa  808  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
707 aa  1448  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.67 
 
 
706 aa  918  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  8.98372e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.97 
 
 
703 aa  863  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.22 
 
 
704 aa  553  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.57 
 
 
779 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 
767 aa  541  1e-152  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  41 
 
 
702 aa  541  1e-152  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.92 
 
 
772 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 
717 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.03341e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.36 
 
 
772 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.06 
 
 
818 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.44 
 
 
829 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 
698 aa  532  1e-150  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.95 
 
 
819 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 
765 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.95 
 
 
819 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.05 
 
 
786 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.86 
 
 
701 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.66 
 
 
714 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  40.83 
 
 
700 aa  526  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.74 
 
 
778 aa  518  1e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.4 
 
 
904 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 
772 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.25 
 
 
832 aa  512  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.33 
 
 
683 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.78 
 
 
685 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 
692 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.92 
 
 
685 aa  508  1e-142  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.88 
 
 
842 aa  506  1e-142  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 
827 aa  506  1e-142  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.79 
 
 
703 aa  508  1e-142  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.7 
 
 
822 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 
740 aa  503  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.82 
 
 
842 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.98 
 
 
681 aa  503  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.03 
 
 
695 aa  504  1e-141  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  39.42 
 
 
818 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.83 
 
 
904 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.54 
 
 
862 aa  502  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.93 
 
 
818 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.63 
 
 
696 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.57 
 
 
815 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.46 
 
 
805 aa  495  1e-138  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.46 
 
 
689 aa  494  1e-138  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.18 
 
 
688 aa  494  1e-138  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.11 
 
 
706 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.04 
 
 
763 aa  490  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 
702 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.69 
 
 
822 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.6 
 
 
753 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.82 
 
 
908 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.62 
 
 
818 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.51 
 
 
817 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.3 
 
 
827 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.75 
 
 
779 aa  485  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.9 
 
 
815 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.09 
 
 
818 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.94 
 
 
689 aa  477  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.72 
 
 
818 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 
679 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.29 
 
 
694 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.97 
 
 
776 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.41 
 
 
773 aa  466  1e-130  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.03 
 
 
846 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.89 
 
 
846 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.26 
 
 
846 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.24 
 
 
680 aa  460  1e-128  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.82 
 
 
682 aa  461  1e-128  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1371  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.16 
 
 
710 aa  460  1e-128  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.393956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
812 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.24 
 
 
682 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.01886e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.54 
 
 
701 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.62 
 
 
691 aa  458  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 
690 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.84 
 
 
690 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.8 
 
 
701 aa  454  1e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 
691 aa  455  1e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.95 
 
 
682 aa  452  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.24 
 
 
682 aa  456  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 
682 aa  454  1e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 
682 aa  454  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.84 
 
 
787 aa  455  1e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 
682 aa  454  1e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.52 
 
 
701 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 
682 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  1.61574e-09 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.65 
 
 
682 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.37 
 
 
657 aa  446  1e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.71 
 
 
685 aa  447  1e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.62 
 
 
720 aa  446  1e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.18 
 
 
747 aa  446  1e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.78 
 
 
728 aa  446  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.67 
 
 
790 aa  446  1e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1516  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.61 
 
 
686 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.83 
 
 
781 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.43 
 
 
686 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>