19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2066 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  100 
 
 
636 aa  1309    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  36.35 
 
 
650 aa  257  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  34.69 
 
 
535 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  37.86 
 
 
521 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  30.25 
 
 
866 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  34.72 
 
 
701 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  34.81 
 
 
880 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  34.79 
 
 
399 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  32.91 
 
 
576 aa  187  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  34.06 
 
 
685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  29.64 
 
 
739 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  33.81 
 
 
545 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  30.93 
 
 
572 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  30.39 
 
 
525 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  37.25 
 
 
427 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  29.35 
 
 
746 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  31.55 
 
 
643 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  34.97 
 
 
377 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  38.52 
 
 
317 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>