159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2061 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
347 aa  714    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.23 
 
 
731 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  41.46 
 
 
731 aa  249  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  39.66 
 
 
727 aa  248  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  33.24 
 
 
334 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  34.49 
 
 
525 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  32.75 
 
 
545 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.92 
 
 
559 aa  175  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.45 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  33.63 
 
 
325 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  33.72 
 
 
339 aa  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
325 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  35.38 
 
 
329 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  34.3 
 
 
339 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.94 
 
 
553 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
325 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.66 
 
 
350 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.77 
 
 
339 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.2 
 
 
339 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  32.46 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  32.93 
 
 
598 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.99 
 
 
338 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
594 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.53 
 
 
570 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  29.51 
 
 
343 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  28.74 
 
 
336 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  33.24 
 
 
326 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.86 
 
 
344 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  33.12 
 
 
333 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  30.5 
 
 
323 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.09 
 
 
550 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  44.04 
 
 
207 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  31.8 
 
 
580 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.63 
 
 
332 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.01 
 
 
333 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  29.18 
 
 
343 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.9 
 
 
341 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.66 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.68 
 
 
343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  29.23 
 
 
343 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.23 
 
 
343 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.03 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  28.65 
 
 
343 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.95 
 
 
330 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  30.5 
 
 
323 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  30.09 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  32.86 
 
 
343 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.41 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  30.23 
 
 
344 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  29.38 
 
 
331 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.7 
 
 
544 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.55 
 
 
342 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  30.11 
 
 
346 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  30.09 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  30.35 
 
 
343 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.84 
 
 
343 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.55 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.77 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.37 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.41 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  30.14 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.25 
 
 
350 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  30.37 
 
 
344 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  28.77 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  29.71 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  31.16 
 
 
338 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  28.41 
 
 
336 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  30.06 
 
 
339 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.54 
 
 
344 aa  122  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.03 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  27.43 
 
 
342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.51 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  25.96 
 
 
333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  25.96 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.62 
 
 
343 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.7 
 
 
331 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  25.74 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  25.29 
 
 
333 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  33 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  26.1 
 
 
331 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  28.21 
 
 
337 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  23.26 
 
 
330 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.84 
 
 
330 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  25.51 
 
 
330 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  24.25 
 
 
330 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.42 
 
 
330 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 
330 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.89 
 
 
330 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.4 
 
 
337 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.93 
 
 
326 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  28.44 
 
 
330 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.23 
 
 
321 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1800  CRISPR-associated protein Cas1  27.89 
 
 
691 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.85 
 
 
331 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.64 
 
 
330 aa  97.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.52 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.21 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0970  hypothetical protein  28.62 
 
 
334 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00123478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>