More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2040 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2040  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
189 aa  391  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  1.70102e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0391  protein tyrosine phosphatase  50.29 
 
 
182 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.558013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0407  protein tyrosine phosphatase  48.1 
 
 
162 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1853  protein tyrosine phosphatase  53.57 
 
 
167 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  43.38 
 
 
158 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
160 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2170  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
155 aa  114  1e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
160 aa  113  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
162 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  41.5 
 
 
172 aa  112  4e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  38.26 
 
 
165 aa  109  2e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0006  protein tyrosine phosphatase  41.61 
 
 
155 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.811776  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
165 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 
173 aa  107  9e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  38.97 
 
 
162 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
166 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2051  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
156 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000114311  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 
182 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  41.89 
 
 
159 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  39.87 
 
 
174 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  42.86 
 
 
154 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 
160 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 
160 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  36.36 
 
 
158 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  40.44 
 
 
162 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  36.03 
 
 
160 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  35.46 
 
 
188 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  38.51 
 
 
164 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3664  protein tyrosine phosphatase  40.94 
 
 
155 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0166  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
156 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138355  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  35.95 
 
 
162 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  36.76 
 
 
160 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1401  protein tyrosine phosphatase  36.84 
 
 
162 aa  100  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595503  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
159 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 
154 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.96 
 
 
157 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  39.46 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  36.17 
 
 
165 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  38.52 
 
 
165 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.81 
 
 
160 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  39.71 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  36.96 
 
 
157 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00584  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  37.75 
 
 
154 aa  99  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.499083  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0815  protein tyrosine phosphatase  43.94 
 
 
161 aa  97.8  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.265223  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  36.53 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.52137e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1422  protein tyrosine phosphatase  34.9 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.67 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  40.67 
 
 
154 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  34 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12743  Protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
150 aa  95.9  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 
164 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 
158 aa  95.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
157 aa  95.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  35.57 
 
 
154 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 
150 aa  94.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  36.57 
 
 
175 aa  94.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  37.16 
 
 
171 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  34.19 
 
 
160 aa  94.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  36.18 
 
 
166 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  36.24 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  34.9 
 
 
160 aa  93.2  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0083  phosphotyrosine protein phosphatase  33.73 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  36.57 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  36.73 
 
 
167 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.82 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  34.04 
 
 
165 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  36.49 
 
 
171 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  33.56 
 
 
155 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  36.49 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
158 aa  92.8  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  7.97417e-05  unclonable  3.87087e-08 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 
163 aa  92.8  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0082  phosphotyrosine protein phosphatase  33.13 
 
 
201 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2313  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
156 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.019528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  35.57 
 
 
154 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1047  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 
154 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4946  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
159 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.565855 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  38.1 
 
 
157 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  35.76 
 
 
171 aa  90.9  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4997  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 
157 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00738059  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  35.57 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.96 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0851  protein tyrosine phosphatase  37.84 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.258007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  33.99 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1426  protein tyrosine phosphatase  37.75 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.03 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.03 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  36.05 
 
 
158 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.96 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  37.96 
 
 
159 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.03 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.03 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.88 
 
 
161 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.03 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  34.44 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>