More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2014 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2014  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000063714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0420  protein of unknown function DUF59  77.71 
 
 
360 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1814  protein of unknown function DUF59  73.3 
 
 
363 aa  531  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0920101  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0399  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  65.23 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2017  protein of unknown function DUF59  66.76 
 
 
368 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  normal  0.693477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2357  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  73.63 
 
 
298 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1652  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  65.47 
 
 
305 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.491623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0926  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  54.42 
 
 
367 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0267061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0046  protein of unknown function DUF59  54.7 
 
 
368 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2226  protein of unknown function DUF59  54.12 
 
 
365 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934574  normal  0.117815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4935  protein of unknown function DUF59  52.5 
 
 
368 aa  355  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1110  ATPase-like, ParA/MinD  51.38 
 
 
367 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.559665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0869  hypothetical protein  48.22 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.671214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  46.99 
 
 
361 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  49.3 
 
 
356 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2325  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.48 
 
 
367 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  50.57 
 
 
359 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  46.2 
 
 
353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  48.73 
 
 
370 aa  328  9e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  46.2 
 
 
353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2109  hypothetical protein  47.92 
 
 
367 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0874248  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  51.14 
 
 
349 aa  324  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1760  hypothetical protein  48.31 
 
 
367 aa  322  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.224371  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  43.1 
 
 
353 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2492  protein of unknown function DUF59  46.76 
 
 
364 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0134384  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  46.4 
 
 
364 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  45.66 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  44.92 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  45.94 
 
 
363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  47.25 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  45.43 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  45.56 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  45.56 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  44.26 
 
 
362 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1575  ATPase-like, ParA/MinD  47.14 
 
 
358 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  47.44 
 
 
362 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  49.56 
 
 
361 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2272  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
361 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00578779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2183  protein of unknown function DUF59  50 
 
 
361 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3344  ATPase-like, ParA/MinD  47.14 
 
 
358 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.312419  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  47.19 
 
 
356 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2528  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.82 
 
 
348 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0638219  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  44.19 
 
 
363 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.1 
 
 
362 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  45.98 
 
 
362 aa  296  4e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1674  hypothetical protein  49.42 
 
 
361 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.905138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  47.37 
 
 
363 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2587  protein of unknown function DUF59  46.06 
 
 
351 aa  294  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.600696  normal  0.426631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  45.4 
 
 
361 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.66 
 
 
362 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  43.27 
 
 
357 aa  293  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  46.59 
 
 
356 aa  293  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  45.7 
 
 
374 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  48.86 
 
 
349 aa  290  3e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.38 
 
 
363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  45.1 
 
 
363 aa  288  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  47.51 
 
 
356 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1831  protein of unknown function DUF59  44.93 
 
 
345 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.203374  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  43.91 
 
 
362 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.82 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1778  ATP/GTP-binding protein  43.84 
 
 
368 aa  287  2e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.82 
 
 
363 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  44.96 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.82 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.82 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.82 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  44.19 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.98 
 
 
362 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1960  ATP/GTP-binding protein  42.82 
 
 
368 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4025  hypothetical protein  42.08 
 
 
379 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  44.01 
 
 
365 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00760  hypothetical protein  43.06 
 
 
376 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  45.38 
 
 
363 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  44.25 
 
 
363 aa  286  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  44.99 
 
 
363 aa  285  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1593  ATP/GTP-binding protein  43.55 
 
 
368 aa  285  7e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0204  Mrp protein  41.57 
 
 
366 aa  285  7e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.3 
 
 
362 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  42.98 
 
 
371 aa  285  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  45.29 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  44.67 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  44.41 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  44.41 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2457  hypothetical protein  43.21 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.12568 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1469  cytochrome c oxidase, heme b and copper-binding subunit, membrane-bound  42.9 
 
 
366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0634786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  41.57 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0959  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  45.25 
 
 
372 aa  282  8.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.152007 
 
 
-
 
NC_004310  BR0057  mrp-related protein  41.38 
 
 
387 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0673  Mrp protein  42.27 
 
 
356 aa  281  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0057  mrp-related protein  41.38 
 
 
394 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0740397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0246  ATP/GTP-binding protein  41.53 
 
 
367 aa  280  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1327  chromosome partitioning ATPase  41.37 
 
 
376 aa  279  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1706  ATPase-like, ParA/MinD  40.46 
 
 
375 aa  279  6e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0562575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  45.66 
 
 
363 aa  279  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  42.29 
 
 
388 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  45.16 
 
 
363 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1044  Mrp/Nbp35 family ATP-binding protein  41.64 
 
 
373 aa  278  9e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17011  MRP-like protein  41.55 
 
 
357 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.995649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  43.48 
 
 
364 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  42.13 
 
 
371 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>