More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2000 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  5.78748e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.01 
 
 
274 aa  439  1e-122  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.19 
 
 
294 aa  428  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  5.07932e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  73.72 
 
 
274 aa  415  1e-115  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  70.8 
 
 
274 aa  405  1e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.03 
 
 
275 aa  385  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.69 
 
 
274 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
279 aa  173  3e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
266 aa  135  1e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
258 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
258 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
270 aa  115  8e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
257 aa  114  1e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
250 aa  114  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
257 aa  114  2e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
252 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.91 
 
 
247 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.02 
 
 
246 aa  109  4e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
256 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
277 aa  108  8e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.88 
 
 
247 aa  108  8e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
261 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  32.4 
 
 
261 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  32.43 
 
 
240 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
276 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3848  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
256 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  34.45 
 
 
258 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
251 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
246 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00370  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  32.13 
 
 
292 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.170907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
263 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  30.54 
 
 
251 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
255 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31904e-06  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
266 aa  105  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 
255 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
246 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.05 
 
 
258 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.66105e-05  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
258 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 
246 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
250 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
249 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.98 
 
 
246 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
254 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
257 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
250 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.97 
 
 
245 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.45701e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
249 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
254 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.08 
 
 
255 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
246 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  31.88 
 
 
254 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  38.27 
 
 
252 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0055984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33 
 
 
266 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
254 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
282 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
249 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
252 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0359  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
251 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.90048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
282 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
282 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1043  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.8589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
257 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.09 
 
 
266 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
226 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00421455  normal  0.304991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3976  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
242 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1405  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
239 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59131e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
242 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1209  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00888886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
242 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
239 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
239 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  8.94376e-15 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1230  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.824936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  30.4 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1368  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.194105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
239 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.61938e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1470  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1429  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
242 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1207  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1231  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  31.2 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  31.2 
 
 
261 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.08 
 
 
246 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 
261 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.72 
 
 
239 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
257 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
244 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  9.89308e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2122  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.84 
 
 
245 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.18784e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 
246 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1330  acetoacetyl-CoA reductase  32.17 
 
 
247 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
242 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
246 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
249 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
269 aa  100  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
253 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>