18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1999 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  58.58 
 
 
178 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  57.76 
 
 
169 aa  192  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  49.67 
 
 
166 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  46.95 
 
 
168 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  45.96 
 
 
169 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  44.03 
 
 
165 aa  147  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  35.15 
 
 
180 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  30.77 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  31.21 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  32.12 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  30.92 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  28.66 
 
 
178 aa  53.9  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  26.51 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  28.49 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1847  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  30 
 
 
175 aa  47.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  23.73 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>