261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1984 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
193 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  73.58 
 
 
193 aa  302  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  59.07 
 
 
193 aa  251  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  56.48 
 
 
193 aa  241  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  67.66 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  54.4 
 
 
194 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  42.86 
 
 
206 aa  164  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  43.71 
 
 
191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  37.77 
 
 
190 aa  147  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  38.12 
 
 
190 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  39.15 
 
 
187 aa  136  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  37.1 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 
185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  37.2 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  32.74 
 
 
265 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  32.74 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  30.5 
 
 
225 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 
220 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  30.35 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 
208 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 
220 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  29.34 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 
358 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  25.39 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 
229 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  27.66 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  28.3 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.99 
 
 
381 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 
197 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  26.85 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 
739 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  32.03 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.41 
 
 
261 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  24.26 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 
739 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  29.27 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2102  hypothetical protein  28.48 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 
739 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 
359 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  26.03 
 
 
452 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.03 
 
 
456 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  23.68 
 
 
333 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  32.33 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  24.88 
 
 
216 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
825 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
825 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
862 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
825 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
825 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
825 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
825 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.56 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  26.28 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.61 
 
 
525 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3692  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.413415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.77 
 
 
348 aa  53.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  24.47 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.78 
 
 
227 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  29.03 
 
 
218 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  32.03 
 
 
976 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  23.03 
 
 
200 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  24.66 
 
 
189 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  24.46 
 
 
179 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  27.18 
 
 
412 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  29.19 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
232 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1438  pentapeptide repeat protein  29.27 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 
233 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  25.97 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 
218 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.36 
 
 
576 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  25.95 
 
 
360 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>