More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1972 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  79.85 
 
 		 397 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  75.06 
 
 		 397 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  812    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  70.2 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.74 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 396 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.87 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.35 
 
 		 446 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.19 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.77 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.69 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.07 
 
 		 404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 394 aa  270  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  37.03 
 
 		 446 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.69 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.13 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.43 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.43 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.04 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.85 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 611 aa  262  8e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 430 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.56 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 441 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.64 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 398 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 409 aa  259  4e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 441 aa  259  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 395 aa  259  6e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  33.67 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.65 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 395 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 		 440 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 414 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  37.24 
 
 		 402 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.7 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 400 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  34.7 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.59 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.29 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  36.71 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.39 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 399 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  32.65 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>