297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1935 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  100 
 
 
226 aa  469  1e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  84.44 
 
 
258 aa  404  1e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  80.09 
 
 
227 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  78.32 
 
 
226 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  78.32 
 
 
226 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  76.55 
 
 
226 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  77.78 
 
 
218 aa  358  5e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  52.44 
 
 
251 aa  257  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  52.23 
 
 
243 aa  256  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  52.02 
 
 
229 aa  251  6e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  50.92 
 
 
223 aa  241  9e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  54.46 
 
 
257 aa  240  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  51.33 
 
 
271 aa  240  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  49.77 
 
 
220 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  47.49 
 
 
220 aa  223  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  45.91 
 
 
221 aa  222  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  47.27 
 
 
222 aa  219  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  46.82 
 
 
222 aa  216  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  47.51 
 
 
221 aa  213  2e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  46.58 
 
 
223 aa  210  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  47.27 
 
 
224 aa  202  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  45 
 
 
224 aa  201  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  44.55 
 
 
224 aa  201  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  44.55 
 
 
224 aa  201  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  43.58 
 
 
221 aa  200  1e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  48.7 
 
 
227 aa  199  2e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  49.34 
 
 
237 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  46.22 
 
 
222 aa  195  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  46.46 
 
 
233 aa  194  8e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  44.69 
 
 
229 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  45.13 
 
 
241 aa  183  2e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  44.89 
 
 
224 aa  181  8e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  45.09 
 
 
225 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  45.74 
 
 
222 aa  178  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  47.56 
 
 
237 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  44.64 
 
 
225 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  46.05 
 
 
226 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  43.75 
 
 
228 aa  174  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  46.64 
 
 
223 aa  174  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  45.81 
 
 
230 aa  174  1e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  43.75 
 
 
226 aa  174  1e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  43.75 
 
 
244 aa  173  2e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  45.81 
 
 
230 aa  173  2e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  44.49 
 
 
233 aa  173  2e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  45.13 
 
 
224 aa  172  3e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  44.39 
 
 
224 aa  172  3e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  44.91 
 
 
230 aa  172  3e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  44.64 
 
 
224 aa  172  4e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  44.69 
 
 
232 aa  171  6e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  44.44 
 
 
224 aa  171  7e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  44.39 
 
 
229 aa  171  7e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  43.42 
 
 
226 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  41.55 
 
 
484 aa  170  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  43.5 
 
 
230 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  43.5 
 
 
226 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  45.33 
 
 
237 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  44.2 
 
 
230 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  43.3 
 
 
227 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  43.81 
 
 
225 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  46.46 
 
 
228 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  45.13 
 
 
223 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.26628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  43.81 
 
 
225 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  43.95 
 
 
224 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  41.88 
 
 
256 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  43.95 
 
 
224 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  44.89 
 
 
224 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  43.95 
 
 
224 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  43.5 
 
 
229 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  43.5 
 
 
228 aa  166  3e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  44.64 
 
 
233 aa  166  3e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  44.64 
 
 
221 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  45.13 
 
 
229 aa  165  6e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  44.44 
 
 
225 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  44.2 
 
 
224 aa  163  2e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  41.41 
 
 
234 aa  163  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  43.98 
 
 
225 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  42.67 
 
 
228 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  40.97 
 
 
234 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  42.6 
 
 
224 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  43.5 
 
 
224 aa  162  4e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  40.97 
 
 
234 aa  162  5e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  43.56 
 
 
230 aa  161  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  40.62 
 
 
227 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  42.67 
 
 
228 aa  161  8e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  43.81 
 
 
234 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  43.11 
 
 
232 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  41.59 
 
 
229 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  41.82 
 
 
236 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  43.56 
 
 
227 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  40.25 
 
 
259 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  42.41 
 
 
229 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  42.41 
 
 
229 aa  159  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  41.59 
 
 
228 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  40.43 
 
 
285 aa  158  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  42.6 
 
 
224 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  40.55 
 
 
224 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  41.98 
 
 
224 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  42.73 
 
 
244 aa  155  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  41.18 
 
 
235 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  42.52 
 
 
231 aa  155  5e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>