70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1909 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  57.7 
 
 		 562 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  61.11 
 
 		 518 aa  636    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1141    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.9 
 
 		 1432 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.02 
 
 		 995 aa  128  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  28.97 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  25.9 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1147 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1299 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1154 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1036 aa  107  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1426 aa  104  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.85 
 
 		 974 aa  103  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1612 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  26.04 
 
 		 629 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1177 aa  99  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.34 
 
 		 1076 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0098  hypothetical protein  26.34 
 
 		 455 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340273  hitchhiker  0.000211537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1338 aa  94.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  22.72 
 
 		 416 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  24.85 
 
 		 481 aa  90.9  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  21.96 
 
 		 1132 aa  88.6  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.77 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.54 
 
 		 527 aa  80.5  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1209 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  20.38 
 
 		 836 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  24.47 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  21.66 
 
 		 570 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0523  hypothetical protein  58.62 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  21.52 
 
 		 1159 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  20.54 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1120 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2488  putative RNA methylase  30.69 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.29 
 
 		 1244 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.89 
 
 		 504 aa  67  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.09 
 
 		 1257 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  24.47 
 
 		 1189 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  27.23 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  23.64 
 
 		 1222 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1231 aa  61.2  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  24.67 
 
 		 1239 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1195 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1184 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1233 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  33.65 
 
 		 1058 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  26.44 
 
 		 950 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  30.53 
 
 		 1256 aa  54.7  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  24.66 
 
 		 1252 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1231 aa  54.7  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 746 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1210 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  24.92 
 
 		 1020 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25 
 
 		 389 aa  51.6  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  20.62 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1209 aa  50.4  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4045  hypothetical protein  29.71 
 
 		 495 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539039  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  32.39 
 
 		 926 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  35.37 
 
 		 684 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.53 
 
 		 1186 aa  48.5  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  32.08 
 
 		 423 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.54 
 
 		 1170 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1178 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  26.13 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4910  N-6 DNA methylase  23.5 
 
 		 584 aa  45.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.268375  normal  0.686666 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  24.4 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  28.87 
 
 		 1160 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1104 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0267  putative modification methyltransferase  20.97 
 
 		 524 aa  43.9  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  19.42 
 
 		 1194 aa  43.5  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>