More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1899 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  91.67 
 
 		 84 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  90.48 
 
 		 84 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 84 aa  149  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1602  50S ribosomal protein L27  84.34 
 
 		 84 aa  147  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  84.52 
 
 		 85 aa  147  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0833  50S ribosomal protein L27  82.14 
 
 		 84 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.5816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 93 aa  104  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0512  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 92 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1749  50S ribosomal protein L27  68 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000203988  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 93 aa  100  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 100 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0896  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000144427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 85 aa  98.6  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3105  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 87 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0213  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.280528 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 87 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  54.76 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3066  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 87 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2957  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>