More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1893 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  48.83 
 
 
1044 aa  718    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  54.04 
 
 
1041 aa  880    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  53 
 
 
1492 aa  870    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  42.94 
 
 
1053 aa  679    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  46.99 
 
 
1049 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  48.25 
 
 
960 aa  717    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  52.25 
 
 
923 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  100 
 
 
1581 aa  3241    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  67.03 
 
 
1183 aa  1607    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  52.19 
 
 
1023 aa  877    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  52.36 
 
 
1049 aa  865    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  52.38 
 
 
1007 aa  830    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  51.6 
 
 
1044 aa  830    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  43.83 
 
 
1201 aa  972    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  49.27 
 
 
1186 aa  1127    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  41.2 
 
 
1190 aa  846    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  47.2 
 
 
1064 aa  738    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  40.32 
 
 
1200 aa  828    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  42.01 
 
 
965 aa  595  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  55.74 
 
 
775 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  42.23 
 
 
639 aa  293  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  32.42 
 
 
644 aa  197  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
1818 aa  189  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  49.73 
 
 
319 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  36.55 
 
 
267 aa  159  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  38.66 
 
 
826 aa  154  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  38 
 
 
433 aa  153  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.88 
 
 
742 aa  152  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.43 
 
 
586 aa  149  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  46.52 
 
 
398 aa  148  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  36.86 
 
 
829 aa  143  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  33.76 
 
 
517 aa  140  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  32.24 
 
 
751 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  47.25 
 
 
398 aa  131  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.01 
 
 
325 aa  127  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.23 
 
 
390 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  35.07 
 
 
348 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.7 
 
 
887 aa  121  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  34.7 
 
 
348 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3236  hypothetical protein  24.08 
 
 
957 aa  115  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  33.81 
 
 
614 aa  115  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  25.74 
 
 
1148 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  41.57 
 
 
293 aa  111  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.21 
 
 
1067 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  32.88 
 
 
517 aa  108  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.86 
 
 
416 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  38.86 
 
 
416 aa  108  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  38.64 
 
 
263 aa  107  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  41.07 
 
 
251 aa  106  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  38.29 
 
 
649 aa  105  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.98 
 
 
1484 aa  104  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.6 
 
 
908 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.6 
 
 
997 aa  102  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0945  hypothetical protein  40.38 
 
 
370 aa  102  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  28.57 
 
 
570 aa  102  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  36.57 
 
 
446 aa  101  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.16 
 
 
942 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 
273 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  30.52 
 
 
338 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  36.14 
 
 
1104 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  31.8 
 
 
892 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  33.93 
 
 
584 aa  99.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  33.21 
 
 
1080 aa  99.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.41 
 
 
888 aa  99.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  37.5 
 
 
417 aa  99.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  27.4 
 
 
2216 aa  99  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 
715 aa  99  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  37.57 
 
 
416 aa  98.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  30.23 
 
 
409 aa  98.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 
303 aa  97.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  36.69 
 
 
766 aa  97.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  25.78 
 
 
1349 aa  98.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  37.7 
 
 
412 aa  97.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  29.87 
 
 
408 aa  97.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  36.31 
 
 
253 aa  97.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.58 
 
 
1345 aa  97.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.56 
 
 
1911 aa  96.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  37.79 
 
 
291 aa  95.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_64  calcineurin-like phosphoesterase  29.5 
 
 
437 aa  95.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515875  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  31.58 
 
 
421 aa  95.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  38.74 
 
 
740 aa  95.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2035  hypothetical protein  36.87 
 
 
338 aa  95.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68876  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  31.31 
 
 
269 aa  95.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  29.55 
 
 
384 aa  95.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  34.18 
 
 
344 aa  95.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  35.98 
 
 
1132 aa  95.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  38.71 
 
 
312 aa  94.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  35.58 
 
 
538 aa  95.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 
276 aa  95.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  27.41 
 
 
818 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  38.55 
 
 
487 aa  94.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  26.63 
 
 
783 aa  94.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2259  hypothetical protein  29.23 
 
 
262 aa  93.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.35 
 
 
951 aa  94.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  31.58 
 
 
377 aa  94.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  28.45 
 
 
390 aa  93.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  33.65 
 
 
952 aa  93.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 
637 aa  93.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 
349 aa  93.2  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  36.22 
 
 
1392 aa  92.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>