More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1887 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  64.31 
 
 
545 aa  679    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  59.22 
 
 
526 aa  634    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
560 aa  1137    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  56.76 
 
 
554 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0842  apolipoprotein N-acyltransferase  57.39 
 
 
537 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  53.44 
 
 
537 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  52.15 
 
 
519 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3257  apolipoprotein N-acyltransferase  31.52 
 
 
533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6937  apolipoprotein N-acyltransferase  29.7 
 
 
538 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.207739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.17 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
521 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0412  apolipoprotein N-acyltransferase  29.36 
 
 
539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.107185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 
507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12383  Apolipoprotein N-acyltransferase  27.72 
 
 
527 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0630157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  30.34 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  31.07 
 
 
477 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
532 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  28.52 
 
 
525 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.2 
 
 
542 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 
510 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  28.35 
 
 
516 aa  170  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  28.97 
 
 
529 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  27.7 
 
 
513 aa  148  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2299  apolipoprotein N-acyltransferase  26.76 
 
 
525 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  31.03 
 
 
505 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  25.74 
 
 
520 aa  140  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  25.97 
 
 
526 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  26.44 
 
 
544 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  25.71 
 
 
553 aa  137  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  25.31 
 
 
524 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  29.45 
 
 
502 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  31.56 
 
 
522 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  31.14 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 
528 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  27.42 
 
 
534 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  28.9 
 
 
505 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
524 aa  127  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  26.42 
 
 
521 aa  127  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  31.12 
 
 
524 aa  126  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.27 
 
 
506 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 
524 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  29.39 
 
 
537 aa  124  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
514 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
515 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  26.63 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  22.7 
 
 
760 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 
541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 
536 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 
553 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  27.9 
 
 
536 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  25.74 
 
 
634 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1507  apolipoprotein N-acyltransferase  26.72 
 
 
501 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 
518 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.27 
 
 
566 aa  120  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
511 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  26.87 
 
 
510 aa  120  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  31.35 
 
 
528 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  27.63 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0363  apolipoprotein N-acyltransferase  25.6 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
523 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  29.52 
 
 
514 aa  118  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  28.96 
 
 
567 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  26.15 
 
 
536 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1124  apolipoprotein N-acyltransferase  28.95 
 
 
511 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.693748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1364  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
488 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00243577  hitchhiker  0.000524625 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  27.73 
 
 
504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3576  apolipoprotein N-acyltransferase  25.62 
 
 
532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.708418  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  29.05 
 
 
567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  30 
 
 
552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  25.41 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  26.74 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 
504 aa  115  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 
556 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  25.37 
 
 
590 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
508 aa  114  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0345  apolipoprotein N-acyltransferase  25.97 
 
 
487 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  29.09 
 
 
531 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
512 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  25.55 
 
 
590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2210  apolipoprotein N-acyltransferase  27.46 
 
 
497 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  27.93 
 
 
507 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  31.9 
 
 
500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  30.77 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1882  apolipoprotein N-acyltransferase  25.25 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  28.34 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  25.35 
 
 
530 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  26.72 
 
 
489 aa  111  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  24.31 
 
 
491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>