More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1862 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  48.41 
 
 		 721 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  71.76 
 
 		 732 aa  1002    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1475  putative Na+/H+ antiporter  66.18 
 
 		 727 aa  887    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  58.32 
 
 		 716 aa  810    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 751 aa  1508    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1103  sodium/hydrogen exchanger  73.99 
 
 		 716 aa  1065    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.554768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2201  sodium/hydrogen exchanger  47.04 
 
 		 708 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  46.44 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  40.68 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 715 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1978  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 709 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0979  sodium/hydrogen exchanger  35.7 
 
 		 688 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4481  sodium/hydrogen exchanger  36.22 
 
 		 679 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  34.94 
 
 		 689 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3545  Sodium/hydrogen exchanger  38.27 
 
 		 681 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0038  sodium/hydrogen exchanger  33.73 
 
 		 692 aa  313  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3051  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 		 686 aa  310  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4587  Sodium/hydrogen exchanger  31.86 
 
 		 712 aa  277  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  31.38 
 
 		 698 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  31.55 
 
 		 698 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  30.6 
 
 		 692 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  30.18 
 
 		 722 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1642  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.43 
 
 		 699 aa  195  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1401  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  30.8 
 
 		 699 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.972731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0307  Na+/H+ antiporter  35.59 
 
 		 408 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.79 
 
 		 386 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.22 
 
 		 609 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.25 
 
 		 609 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  24.22 
 
 		 609 aa  107  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.85 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  23.85 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  23.85 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.85 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  23.85 
 
 		 609 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  23.85 
 
 		 609 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0768  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.84 
 
 		 609 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0743  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 		 395 aa  101  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0587  sodium/hydrogen exchanger  23.46 
 
 		 609 aa  97.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.013374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0590  Na+/H+ exchanger family protein, putative  26.88 
 
 		 614 aa  93.6  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1027  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000401836  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1008  sodium/hydrogen exchanger  28.44 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000272114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1020  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 389 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.259417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  21.82 
 
 		 756 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 		 611 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0306  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 		 389 aa  87.8  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 		 396 aa  87.8  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0867  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 530 aa  87.4  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.638156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0162  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.12 
 
 		 608 aa  86.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000463033  unclonable  1.19367e-27 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  31.53 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1608  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0247605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 		 389 aa  84  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 		 388 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1067  sodium/hydrogen exchanger  27.79 
 
 		 609 aa  84  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000397977  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  25.5 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  23.7 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  27.41 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  24.22 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  24.53 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  24.22 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  24.22 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  24.22 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  24.53 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  24.53 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  24.22 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  23.91 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  25.39 
 
 		 352 aa  77  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  23.18 
 
 		 389 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  24.07 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  24.22 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.81 
 
 		 620 aa  75.5  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  23.67 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  25.8 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  30.94 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  25.73 
 
 		 586 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.5 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.5 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.5 
 
 		 620 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  29.5 
 
 		 620 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  28.84 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.07 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  23.87 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  23.87 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  23.87 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  23.87 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  23.87 
 
 		 375 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.84 
 
 		 620 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.12 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 		 586 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  23.66 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  25.08 
 
 		 586 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  28.84 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.84 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.84 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  28.84 
 
 		 620 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>