More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1841 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  59.78 
 
 
1094 aa  946  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  54.85 
 
 
4489 aa  2583  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
3035 aa  6219  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  72.63 
 
 
3560 aa  3371  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 
732 aa  641  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  48.14 
 
 
761 aa  730  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 
618 aa  566  1e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  41.8 
 
 
1085 aa  557  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  38.9 
 
 
909 aa  548  1e-154  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  46.05 
 
 
654 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
740 aa  510  1e-142  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  40.46 
 
 
660 aa  506  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  35.71 
 
 
816 aa  489  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  41.76 
 
 
647 aa  482  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  36.34 
 
 
750 aa  468  1e-130  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  37.87 
 
 
700 aa  455  1e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  41.26 
 
 
667 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
808 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  37.91 
 
 
739 aa  427  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  42.75 
 
 
611 aa  407  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
1714 aa  399  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  42.2 
 
 
569 aa  389  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 
706 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 
616 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  39.78 
 
 
574 aa  367  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  45.68 
 
 
492 aa  360  2e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  44.62 
 
 
459 aa  358  6e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  42.42 
 
 
452 aa  338  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  50.56 
 
 
395 aa  329  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
824 aa  325  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
750 aa  323  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
789 aa  322  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  54.01 
 
 
295 aa  322  5e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  4.90816e-07  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  37.24 
 
 
568 aa  317  2e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
828 aa  315  6e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
828 aa  313  3e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
732 aa  310  2e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  35.27 
 
 
560 aa  307  2e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
828 aa  307  2e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  34.93 
 
 
680 aa  307  2e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
754 aa  306  5e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 
718 aa  303  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  36.49 
 
 
590 aa  303  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
570 aa  302  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
590 aa  300  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
754 aa  300  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  41.35 
 
 
1694 aa  299  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
672 aa  296  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.14 
 
 
632 aa  293  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.94 
 
 
739 aa  289  6e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  41.1 
 
 
657 aa  289  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  28.63 
 
 
715 aa  288  1e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
833 aa  288  1e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.26 
 
 
742 aa  284  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
833 aa  284  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
713 aa  284  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  40.31 
 
 
657 aa  283  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
632 aa  280  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  40.47 
 
 
566 aa  275  8e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  39.64 
 
 
633 aa  275  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  39.69 
 
 
1276 aa  269  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 
708 aa  265  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
968 aa  265  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  39.13 
 
 
630 aa  261  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
1252 aa  259  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.67 
 
 
739 aa  259  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
626 aa  258  1e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  39.04 
 
 
637 aa  258  2e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
1252 aa  256  5e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  34.91 
 
 
588 aa  254  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.59 
 
 
1154 aa  253  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
595 aa  253  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
598 aa  252  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.48 
 
 
937 aa  250  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.33 
 
 
585 aa  248  1e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
619 aa  245  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 
1106 aa  243  3e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.99 
 
 
739 aa  241  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
1106 aa  240  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
647 aa  238  1e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  34.68 
 
 
624 aa  237  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  36.17 
 
 
582 aa  236  7e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.69 
 
 
708 aa  233  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.3 
 
 
740 aa  231  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
717 aa  229  5e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.42 
 
 
810 aa  228  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.85 
 
 
1221 aa  228  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
717 aa  228  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
878 aa  228  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.96 
 
 
667 aa  226  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
734 aa  225  1e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.61 
 
 
589 aa  225  1e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
543 aa  223  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.44 
 
 
699 aa  220  3e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  36.9 
 
 
573 aa  220  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 
681 aa  219  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  37.76 
 
 
764 aa  218  2e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.02 
 
 
711 aa  217  3e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  28.59 
 
 
1415 aa  216  5e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
627 aa  216  5e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>