235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1827 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1827  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
115 aa  235  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1015  anti-sigma-factor antagonist  56.19 
 
 
107 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155666  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  45.79 
 
 
107 aa  103  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  47.22 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  40.82 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  41.84 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.5 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  34.74 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  33.04 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  32.98 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 
115 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.38 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  30.19 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  34.95 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 
113 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.52 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  27.97 
 
 
117 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  32.63 
 
 
112 aa  57.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  36.47 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  33.01 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  36.47 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  34.38 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  27.37 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.26 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  38.81 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.34 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  30.48 
 
 
111 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.06 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  29.67 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2764  anti-sigma factor antagonist  31.91 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 
109 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  32.98 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  30.53 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
113 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  28.97 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  29.13 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  28.95 
 
 
116 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  26.32 
 
 
111 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  37.5 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2516  anti-sigma-factor antagonist  30.39 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  30.21 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  28.83 
 
 
111 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.3 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  29.46 
 
 
116 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  26.21 
 
 
111 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  26.21 
 
 
111 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  33.33 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.72 
 
 
129 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 
109 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  35.82 
 
 
111 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.47 
 
 
110 aa  50.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  36.21 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4051  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.41 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1691  anti-sigma-factor antagonist  38.46 
 
 
125 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0136319  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  35.94 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0047  anti-sigma-factor antagonist  29.7 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32030  anti-anti-sigma factor  32.98 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320357  normal  0.297134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2067  anti-sigma-factor antagonist  23.71 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  30 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  26.21 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0427  anti-anti-sigma factor  35.48 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 
249 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0388  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>