20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1820 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  63.29 
 
 		 586 aa  750    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 586 aa  1173    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  69.76 
 
 		 583 aa  827    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  55.2 
 
 		 591 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  30.87 
 
 		 938 aa  160  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 494 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 424 aa  54.3  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  23.91 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 514 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 504 aa  47.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 452 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.4 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 519 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2896  polysaccharide biosynthesis protein  28.81 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  32.98 
 
 		 505 aa  45.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  33.85 
 
 		 511 aa  44.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 486 aa  43.9  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>